RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 CAND2O75155 1236 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 RFC2P35250 354 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 PRPHP41219 470 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM240Q5SV17 173 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 RPAINQ86UA6 219 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 RSPH3Q86UC2 560 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 NEK9Q8TD19 979 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 ZBTB39O15060 712 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 NBNO60934 754 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM62Q0P6H9 643 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 PKP1Q13835 747 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 METTL13Q8N6R0 699 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 TET1Q8NFU7 2136 aa26.7■■□□□ 1.87
UBE2E3-202ENST00000410062 CHRNA1P02708 482 aa26.7■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.7■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 YWHABP31946 246 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 NPEPPSP55786 919 aa26.7■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CEP89Q96ST8 783 aa26.7■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.7■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CLIC4Q9Y696 253 aa26.7■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 MAGEB2O15479 319 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 MED24O75448 989 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 PDIA5Q14554 519 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM26DQ5JW98 314 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CATSPER3Q86XQ3 398 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC71Q8N4P6 559 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 ERMNQ8TAM6 284 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 OSBPL7Q9BZF2 842 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CYP26B1Q9NR63 512 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A087WWV3 80 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A1W2PPC1 479 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 PARNO95453 639 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 FGBP02675 491 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 PFKMP08237 780 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CLCN3P51790 818 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 MGAT3Q09327 533 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 EFCAB12Q6NXP0 572 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 OTOP2Q7RTS6 562 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 RAB34Q9BZG1 259 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CDY2AQ9Y6F7 541 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 PP2D1A8MPX8 630 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CEP170P1Q96L14 293 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 SIP14410 1827 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 LYPLA2O95372 231 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CXCL10P02778 98 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 BMP15O95972 392 aa26.66■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 RPA1P27694 616 aa26.66■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CDC25AP30304 524 aa26.66■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 XKR9Q5GH70 373 aa26.66■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 IER5Q5VY09 327 aa26.66■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 POTEGQ6S5H5 508 aa26.66■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 NME8Q8N427 588 aa26.66■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 LINC01465Q8N7H1 131 aa26.66■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.66■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP1R16BQ96T49 567 aa26.66■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 VTNP04004 478 aa26.65■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 HAUS3Q68CZ6 603 aa26.65■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.65■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 USP28Q96RU2 1077 aa26.65■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 M0QZ92 97 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 MAFO75444 373 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 F13A1P00488 732 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 TMOD1P28289 359 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 DRP2Q13474 957 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 PTPAQ15257 358 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 ECM1Q16610 540 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 TCTN1Q2MV58 587 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 HERVK_113Q902F9 699 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 AKT3Q9Y243 479 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 GINS2Q9Y248 185 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2E3-202ENST00000410062 TRPV2Q9Y5S1 764 aa26.64■■□□□ 1.86
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