RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 PODXLO00592 558 aa19.88■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TJP3O95049 919 aa19.88■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 SNAP25P60880 206 aa19.88■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 VPS39Q96JC1 886 aa19.88■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 DRC3Q9H069 523 aa19.88■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 RPS6KA4O75676 772 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 RPSAP08865 295 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 GINM1Q9NU53 330 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 PMLP29590 882 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 PIGOQ8TEQ8 1089 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 ADAM22Q9P0K1 906 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 F8W8V4 182 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 MMP10P09238 476 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 SLC7A5Q01650 507 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TMEM47Q9BQJ4 181 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 CEP72Q9P209 647 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 MTMR1Q13613 665 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 ATG16L1Q676U5 607 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 ZWILCHQ9H900 591 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 FBXO40Q9UH90 709 aa19.87■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 ELF1P32519 619 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 INPP1P49441 399 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 KLC3Q6P597 504 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TMEM35BQ8NCS4 154 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 FBXO41Q8TF61 875 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 SLC10A4Q96EP9 437 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 DONSONQ9NYP3 566 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 SLC8A2Q9UPR5 921 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 UGGT1Q9NYU2 1555 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 CDO1Q16878 200 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 XXYLT1Q8NBI6 393 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 GDAP1Q8TB36 358 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 PTCH1Q13635 1447 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 LGALS16A8MUM7 142 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 GSTA4O15217 222 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 PLS3P13797 630 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 SARM1Q6SZW1 724 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 UBN2Q6ZU65 1347 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 USP17L5A8MUK1 530 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 CHEK2O96017 543 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 PRELPP51888 382 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 ART3Q13508 389 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 E2F5Q15329 346 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TBC1D10CQ8IV04 446 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 RMDN3Q96TC7 470 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 CLDN3O15551 220 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 KRT37O76014 449 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 RCAN1P53805 252 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 KLC2Q9H0B6 622 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 CRKP46108 304 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TTC25Q96NG3 672 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 MTA3Q9BTC8 594 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 ABCB6Q9NP58 842 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TBC1D22BQ9NU19 505 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 POTEMA6NI47 508 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 CYP2D6P10635 497 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TFDP2Q14188 446 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 STXBP2Q15833 593 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 HLFQ16534 295 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 SFR1Q86XK3 245 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 HSPH1Q92598 858 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 FAM20AQ96MK3 541 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 ANAPC7Q9UJX3 599 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 NFU1Q9UMS0 254 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 WDR91A4D1P6 747 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 MYO1CO00159 1063 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 NR3C1P04150 777 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 PRDX5P30044 214 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 SOX5P35711 763 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 ESRRGP62508 458 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 MAPK6Q16659 721 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 WDR19Q8NEZ3 1342 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 ACSL3O95573 720 aa19.84■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 CIITAP33076 1130 aa19.84■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
USP25-204ENST00000400183 TRIM67Q6ZTA4 783 aa19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms