RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 PPFIA3O75145 1194 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 C22orf31O95567 290 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 KRT76Q01546 638 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 RNF19AQ9NV58 838 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 MUTYHQ9UIF7 546 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 C9IYK1 514 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 GPR32O75388 356 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 EYA4O95677 639 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 CYP3A4P08684 503 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 AP3B2Q13367 1082 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 SWSAP1Q6NVH7 229 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 HFE2Q6ZVN8 426 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 NIPA1Q7RTP0 329 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 FAM228AQ86W67 206 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 POF1BQ8WVV4 589 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 LENG9Q96B70 501 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 GINS2Q9Y248 185 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 NCK2O43639 380 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 HBP1O60381 514 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ALADP13716 330 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 NRIP1P48552 1158 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 APOBRQ0VD83 1088 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 DSC3Q14574 896 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 KIZQ2M2Z5 673 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 RNF135Q8IUD6 432 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 NME8Q8N427 588 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 EFHBQ8N7U6 833 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 KCNB2Q92953 911 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 OSMRQ99650 979 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ADAM2Q99965 735 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 CD207Q9UJ71 328 aa15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 EVPLQ92817 2033 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 M0QZ92 97 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 BACH1O14867 736 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 VTNP04004 478 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 FGFR1P11362 822 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 SLC26A2P50443 739 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ERVFC1P60507 584 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 NTRK3Q16288 839 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 PDXDC2PQ6P474 469 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 SMRP1Q8NCR6 262 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 GJA10Q969M2 543 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 CWH43Q9H720 699 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF302Q9NR11 478 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 RGS18Q9NS28 235 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 COL1A2P08123 1366 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 NID2Q14112 1375 aa15.11■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ESYT2A0FGR8 921 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 TBKBP1A7MCY6 615 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 PER2O15055 1255 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF862O60290 1169 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 RPS6KA5O75582 802 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 CLCN3P51790 818 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 FAM189BP81408 668 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 UGCGQ16739 394 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 NAALADL2Q58DX5 795 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 RNF20Q5VTR2 975 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 LRRC55Q6ZSA7 311 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 PHKBQ93100 1093 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 FBXL18Q96ME1 805 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 FSCN2O14926 492 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 STAG3L1P0CL83 205 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF76P36508 570 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 NDUFV1P49821 464 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 RCAN1P53805 252 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 COASYQ13057 564 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 KCNC3Q14003 757 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF484Q5JVG2 852 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 Q6ZUG5 572 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 BRF1Q92994 677 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-202ENST00000393503 ADAMTS10Q9H324 1103 aa15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms