RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 RARRES1P49788 294 aa31.46■■■□□ 2.63
GIPC1-202ENST00000393028 KRBA2Q6ZNG9 492 aa31.46■■■□□ 2.63
GIPC1-202ENST00000393028 CEP57L1Q8IYX8 460 aa31.46■■■□□ 2.63
GIPC1-202ENST00000393028 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa31.46■■■□□ 2.63
GIPC1-202ENST00000393028 NRBP2Q9NSY0 501 aa31.46■■■□□ 2.63
GIPC1-202ENST00000393028 ANKEF1Q9NU02 776 aa31.46■■■□□ 2.63
GIPC1-202ENST00000393028 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
GIPC1-202ENST00000393028 ARHGEF35A5YM69 484 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 MOXD2PA6NHM9 499 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 KINO60870 393 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 MBD3O95983 291 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 GJA8P48165 433 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 CNNM3Q8NE01 707 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 CEP170P1Q96L14 293 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 A0A1W2PQY0 241 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 HBP1O60381 514 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 SLFN14P0C7P3 912 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 PTMSP20962 102 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 SLC12A3P55017 1021 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 OTUD6AQ7L8S5 288 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 KCTD17Q8N5Z5 321 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM106CQ9BVX2 250 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 CUEDC2Q9H467 287 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 CYP26B1Q9NR63 512 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 PHF24Q9UPV7 400 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 ZBTB42B2RXF5 422 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 INSRRP14616 1297 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 AFMP43652 599 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 IGBP1P78318 339 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 PPFIA1Q13136 1202 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 MTRQ99707 1265 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 USP25Q9UHP3 1055 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 NBPF20Q3BBV1 942 aa31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 GPBP1Q86WP2 473 aa31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 VTI1AQ96AJ9 217 aa31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 RUSC1Q9BVN2 902 aa31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 USO1O60763 962 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 SV2BQ7L1I2 683 aa31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 ZBTB10Q96DT7 871 aa31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 GLT1D1Q96MS3 346 aa31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 CABYRO75952 493 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 CASP1P29466 404 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 GRIK4Q16099 956 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 PADI6Q6TGC4 694 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 PAGE5Q96GU1 130 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 CEP89Q96ST8 783 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 SETD4Q9NVD3 440 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 KBTBD4Q9NVX7 518 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 HDAC6Q9UBN7 1215 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 GRIN2DO15399 1336 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 PRR29P0C7W0 189 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 HIC1Q14526 733 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 C7orf31Q8N865 590 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 LMBR1Q8WVP7 490 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 TIGD1Q96MW7 591 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 TNMDQ9H2S6 317 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 MAGEF1Q9HAY2 307 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 COL1A2P08123 1366 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 FAM47CQ5HY64 1035 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF484Q5JVG2 852 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 RINT1Q6NUQ1 792 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 STARD7Q9NQZ5 370 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-202ENST00000393028 DNAH12Q6ZR08 3092 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 MYMKA6NI61 221 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 CYP11B2P19099 503 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 ARSHQ5FYA8 562 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa31.38■■■□□ 2.61
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GIPC1-202ENST00000393028 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 ITGA7Q13683 1181 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 CAMK4Q16566 473 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 CLSTN2Q9H4D0 955 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 EMC2Q15006 297 aa31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 C1orf186Q6ZWK4 172 aa31.36■■■□□ 2.61
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GIPC1-202ENST00000393028 DYMQ7RTS9 669 aa31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 POLD4Q9HCU8 107 aa31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 C17orf102A2RUQ5 167 aa31.35■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 C22orf31O95567 290 aa31.35■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 SOX10P56693 466 aa31.35■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 PNOCQ13519 176 aa31.35■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 CUL4BQ13620 913 aa31.35■■■□□ 2.61
GIPC1-202ENST00000393028 KLHL40Q2TBA0 621 aa31.35■■■□□ 2.61
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