RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 NME8Q8N427 588 aa24.74■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.74■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 RGL1Q9NZL6 768 aa24.74■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 SIP14410 1827 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM150BA6NC51 233 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAGEB2O15479 319 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 LPIN1Q14693 890 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 IER5Q5VY09 327 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 MCTP1Q6DN14 999 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 PBX4Q9BYU1 374 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 SZT2Q5T011 3432 aa24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR52Z1P0C646 297 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 GHRP10912 638 aa24.72■■□□□ 1.55
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IGHV3-20-201ENST00000390606 PBX2P40425 430 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 IKBKEQ14164 716 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANO5Q75V66 913 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEPT8Q92599 483 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 DYDC2Q96IM9 177 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC9A7Q96T83 725 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 LXNQ9BS40 222 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 EVPLQ92817 2033 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC34A2O95436 690 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAJB2P25686 324 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 MTERF2Q49AM1 385 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 Q7L0L9 218 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 C4orf19Q8IY42 314 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 HSD17B14Q9BPX1 270 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 SH2D3AQ9BRG2 576 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 POTEMA6NI47 508 aa24.7■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 EFCAB14O75071 495 aa24.7■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLITRK3O94933 977 aa24.7■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 CLCN3P51790 818 aa24.7■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEFB103AP81534 67 aa24.7■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP4A11Q02928 519 aa24.7■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.7■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 METTL13Q8N6R0 699 aa24.7■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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IGHV3-20-201ENST00000390606 SQORQ9Y6N5 450 aa24.7■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 M0QZ92 97 aa24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNJ6P48051 423 aa24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 RABGGTBP53611 331 aa24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEFB123Q8N688 67 aa24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM265A0A087WTH1 108 aa24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 VTNP04004 478 aa24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF697Q5TEC3 545 aa24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 NEK9Q8TD19 979 aa24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 APBB2Q92870 758 aa24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 TIFAQ96CG3 184 aa24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTPRSQ13332 1948 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPR32O75388 356 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 LYPLA2O95372 231 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 TECP42680 631 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 NPEPPSP55786 919 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTGDRQ13258 359 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 DRP2Q13474 957 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAB30Q15771 203 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 TPH2Q8IWU9 490 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 USP38Q8NB14 1042 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZBTB39O15060 712 aa24.66■■□□□ 1.54
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
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