RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM26DQ5JW98 314 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZUG5 572 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 RAPH1Q70E73 1250 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 KSR1Q8IVT5 923 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-202ENST00000380828 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-202ENST00000380828 CPDO75976 1380 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01387J3KSC0 135 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 E2F3O00716 465 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAM9Q13443 819 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CCINQ13939 588 aa7.39□□□□□ -1.23
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