RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377060.7

CNNM3-202, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNNM3, Length 3,308 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3-202ENST00000377060 GALCP54803 685 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 ICA1Q05084 483 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 GBP6Q6ZN66 633 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 CPLX4Q7Z7G2 160 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 HOOK2Q96ED9 719 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 FAM84AQ96KN4 292 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 EML1O00423 815 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 SORBS3O60504 671 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 GIT2Q14161 759 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 CCDC38Q502W7 563 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 BCORQ6W2J9 1755 aa20.33■□□□□ 0.85
CNNM3-202ENST00000377060 VPS41P49754 854 aa20.33■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 PROM2Q8N271 834 aa20.33■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 ERMNQ8TAM6 284 aa20.33■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 CCDC114Q96M63 670 aa20.33■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.33■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 EVI5O60447 810 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 RPS6KA5O75582 802 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 PPP1R37O75864 691 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 NLRP14Q86W24 1093 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 SCLT1Q96NL6 688 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 STAT1P42224 750 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 PALB2Q86YC2 1186 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 IQCKQ8N0W5 287 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 CD248Q9HCU0 757 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 TSKSQ9UJT2 592 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 PJA2O43164 708 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 MCTP2Q6DN12 878 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 GANQ9H2C0 597 aa20.32■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 F5H6K3 240 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 EXOC3O60645 756 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 KLRC3Q07444 240 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 PPP2R5AQ15172 486 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 NSMFQ6X4W1 530 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 CALCAP01258 141 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 PRLRP16471 622 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 TNFAIP3P21580 790 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 E2F5Q15329 346 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 DYDC2Q96IM9 177 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 CABS1Q96KC9 395 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 BTBD6Q96KE9 485 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 GDF3Q9NR23 364 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.31■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.845e-8■■■□□ 17.9
CNNM3-202ENST00000377060 GH2P01242 217 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 MESDQ14696 234 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 FBXO11Q86XK2 927 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 DOCK2Q92608 1830 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 LRP5O75197 1615 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 ESYT2A0FGR8 921 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 GNA14O95837 355 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 TEKT1Q969V4 418 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 CEP63Q96MT8 703 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 SH3GL2Q99962 352 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 USP21Q9UK80 565 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 AMFRQ9UKV5 643 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 CASZ1Q86V15 1759 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 SCP2P22307 547 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 GJC1P36383 396 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 SP4Q02446 784 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 ODR4Q5SWX8 454 aa20.3■□□□□ 0.84
CNNM3-202ENST00000377060 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms