RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.85■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.84■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.84■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PHOX2BQ99453 314 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.83■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 NAPAP54920 295 aa21.83■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 UBE2SQ16763 222 aa21.83■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.82■■□□□ 1.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SDF4Q9BRK5 362 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMX1Q9H3N1 280 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.81■■□□□ 1.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TLR9Q9NR96 1032 aa21.81■■□□□ 1.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ACTR2P61160 394 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SIGLEC14Q08ET2 396 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.8■■□□□ 1.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 NFASCO94856 1347 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 DENND3A2RUS2 1198 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 ST18O60284 1047 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC26A2P50443 739 aa21.79■■□□□ 1.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.79■■□□□ 1.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 GINS2Q9Y248 185 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP34Q70CQ2 3546 aa21.79■■□□□ 1.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 KLRC1P26715 233 aa21.78■■□□□ 1.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SUSD6Q92537 303 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAM2Q99965 735 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.78■■□□□ 1.08
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