RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 C1QL4Q86Z23 238 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ATL2Q8NHH9 583 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 KCND1Q9NSA2 647 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR39O43194 453 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 COL6A1P12109 1028 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF28P17035 718 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 LSP1P33241 339 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ADCY1Q08828 1119 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 DDB1Q16531 1140 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 BROXQ5VW32 411 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 LILRA6Q6PI73 481 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 NME9Q86XW9 330 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC5A5Q92911 643 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 E2F7Q96AV8 911 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXB1Q99853 325 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 BTBD2Q9BX70 525 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 NTMQ9P121 344 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 MCM8Q9UJA3 840 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 KNG1P01042 644 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 PRLP01236 227 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 CHGBP05060 677 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 CD40P25942 277 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 IL13RA1P78552 427 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 STILQ15468 1287 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC38Q5R3I4 469 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 CARFQ8N187 725 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 MAML3Q96JK9 1138 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 PHLDB1Q86UU1 1377 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 LCHNA4D1U4 455 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ULK1O75385 1050 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 TMPRSS15P98073 1019 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC6A3Q01959 620 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 KANK2Q63ZY3 851 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 RASSF3Q86WH2 238 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 CALML6Q8TD86 181 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 OR10A5Q9H207 317 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL18O94889 574 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 RGS3P49796 1198 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 SLURP1P55000 103 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 SESN3P58005 492 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 EVA1CP58658 441 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 CD83Q01151 205 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ROM1Q03395 351 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 MCTP2Q6DN12 878 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR48Q8TAF3 677 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT11Q96G61 164 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA25Q9BR10 227 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 POFUT1Q9H488 388 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 MSRAQ9UJ68 235 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 H0Y858 1186 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 PRRG2O14669 202 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB11FIP3O75154 756 aa5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms