RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362830.1

RNU6-223P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 223, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-223P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-223P-201ENST00000362830 OVCH1Q7RTY7 1134 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 KBTBD2Q8IY47 623 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 KATNBL1Q9H079 304 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZDHHC9Q9Y397 364 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF536O15090 1300 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 PTGS1P23219 599 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 AOAHP28039 575 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 ID4P47928 161 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF827Q17R98 1081 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 PHF19Q5T6S3 580 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 GLB1LQ6UWU2 654 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 NOSTRINQ8IVI9 506 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 BORCS6Q96GS4 357 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRIM8Q9BZR9 551 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMX1Q9H3N1 280 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 KCNH7Q9NS40 1196 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 GALNT8Q9NY28 637 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 BTBD7Q9P203 1132 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 PHLDB1Q86UU1 1377 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC12A8A0AV02 714 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 B4E1Z4 1266 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 OPA1O60313 960 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 B4GALT4O60513 344 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 KPNA6O60684 536 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 JMJD7P0C870 316 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 POLD1P28340 1107 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 SDHAP31040 664 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 CSF2RBP32927 897 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 STILQ15468 1287 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLFN13Q68D06 897 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 OTOP1Q7RTM1 612 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 DLG3Q92796 817 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 WNK4Q96J92 1243 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 BTBD2Q9BX70 525 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 INCENPQ9NQS7 918 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 SMPD4Q9NXE4 827 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 FBXO10Q9UK96 956 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 COQ6Q9Y2Z9 468 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRAMEF25A6NGN4 478 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 ASLP04424 464 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 SOX5P35711 763 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 KRTAP10-2P60368 255 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 ADAM17P78536 824 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 STRN3Q13033 797 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMEM177Q53S58 311 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 NXPE1Q8N323 547 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 C2orf69Q8N8R5 385 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 ASB1Q9Y576 335 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRAF5O00463 557 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 SCDO00767 359 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 NEMP1O14524 444 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 KCNK3O14649 394 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 FOXP2O15409 715 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 KATNA1O75449 491 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 MPIG6BO95866 241 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 IGFALSP35858 605 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 ETV4P43268 484 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 NEK4P51957 841 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 SEC23AQ15436 765 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 LOXL4Q96JB6 756 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 SCYL1Q96KG9 808 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 CHPF2Q9P2E5 772 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 GOLGA6L22H0YM25 854 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 M0R2C6 588 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 GPR42O15529 346 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-223P-201ENST00000362830 HIP1RO75146 1068 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms