RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 VAMP4O75379 141 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 PF4V1P10720 104 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 HSPA6P17066 643 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 VCAM1P19320 739 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 CYP2C19P33261 490 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 POU4F1Q01851 419 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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CCL20-201ENST00000358813 TMEM240Q5SV17 173 aa6.87□□□□□ -1.31
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CCL20-201ENST00000358813 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 TPH2Q8IWU9 490 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ABI1Q8IZP0 508 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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CCL20-201ENST00000358813 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.87□□□□□ -1.31
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CCL20-201ENST00000358813 USP25Q9UHP3 1055 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 AKAP12Q02952 1782 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 CASZ1Q86V15 1759 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ARVCFO00192 962 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ERC2O15083 957 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 PPFIA4O75335 1185 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 MT-CO1P00395 513 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 CFBP00751 764 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 IL2RBP14784 551 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 SESN3P58005 492 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ERVK-21P61565 698 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 SCRN1Q12765 414 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 GTF2H3Q13889 308 aa6.86□□□□□ -1.31
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CCL20-201ENST00000358813 INAVAQ3KP66 663 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 PJA1Q8NG27 643 aa6.86□□□□□ -1.31
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CCL20-201ENST00000358813 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ADGRB1O14514 1584 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 USP6P35125 1406 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 TNS2Q63HR2 1409 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ATP10DQ9P241 1426 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 EVC2Q86UK5 1308 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 LRRN2O75325 713 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 KRT85P78386 507 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 CHST14Q8NCH0 376 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 USP33Q8TEY7 942 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 PPM1EQ8WY54 764 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 BCL9O00512 1426 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 CCDC189A1A4V9 331 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 TRAF5O00463 557 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 PHKG2P15735 406 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 FUT4P22083 530 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 IRAK1P51617 712 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 ZP2Q05996 745 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 CYP4F3Q08477 520 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 PAK1Q13153 545 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 GBX1Q14549 363 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 TMEM177Q53S58 311 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-201ENST00000358813 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.84□□□□□ -1.31
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