RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
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GDE1-201ENST00000353258 ABL2P42684 1182 aa18.28■□□□□ 0.52
GDE1-201ENST00000353258 SLC18A3Q16572 532 aa18.28■□□□□ 0.52
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GDE1-201ENST00000353258 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.27■□□□□ 0.52
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.27■□□□□ 0.52
GDE1-201ENST00000353258 KIF2BQ8N4N8 673 aa18.27■□□□□ 0.52
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GDE1-201ENST00000353258 A6NHS1 94 aa18.25■□□□□ 0.51
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GDE1-201ENST00000353258 FESP07332 822 aa18.24■□□□□ 0.51
GDE1-201ENST00000353258 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
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GDE1-201ENST00000353258 KCNV2Q8TDN2 545 aa18.24■□□□□ 0.51
GDE1-201ENST00000353258 FMO2Q99518 471 aa18.24■□□□□ 0.51
GDE1-201ENST00000353258 TRIM51Q9BSJ1 452 aa18.24■□□□□ 0.51
GDE1-201ENST00000353258 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
GDE1-201ENST00000353258 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa18.24■□□□□ 0.51
GDE1-201ENST00000353258 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.24■□□□□ 0.51
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