RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 CHMP2AO43633 222 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 DTNBO60941 627 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 STBD1O95210 358 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 C22orf31O95567 290 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 EPHB4P54760 987 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 HAUS3Q68CZ6 603 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 MCTP1Q6DN14 999 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF365Q70YC5 407 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC01465Q8N7H1 131 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 VWCEQ96DN2 955 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 ANKEF1Q9NU02 776 aa13.69□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 SLITRK3O94933 977 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 SYT1P21579 422 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 RPA1P27694 616 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 RFC5P40937 340 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 TXKP42681 527 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 FOSBP53539 338 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 MGAT3Q09327 533 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 PTGDRQ13258 359 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 IKBKEQ14164 716 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 GPNMBQ14956 572 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 IGSF22Q8N9C0 903 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 SEPT8Q92599 483 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 WNT8BQ93098 351 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 SCLYQ96I15 445 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC9A7Q96T83 725 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 LXNQ9BS40 222 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 FTHL17Q9BXU8 183 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM60Q9H2L4 133 aa13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 TET1Q8NFU7 2136 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 WNT7AO00755 349 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 NBNO60934 754 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 MAFO75444 373 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 CHRNA1P02708 482 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 YWHABP31946 246 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 DNM2P50570 870 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF174Q15697 407 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 UGCGQ16739 394 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 C9orf50Q5SZB4 431 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 NCAPH2Q6IBW4 605 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 ANO5Q75V66 913 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 GJA10Q969M2 543 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 AK8Q96MA6 479 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 CEP89Q96ST8 783 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 MAP7D2Q96T17 732 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 CYP26B1Q9NR63 512 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 CHD9Q3L8U1 2897 aa13.67□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 ASAP2O43150 1006 aa13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 STX6O43752 255 aa13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 IGBP1P78318 339 aa13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 MBTPS1Q14703 1052 aa13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 DTHD1Q6ZMT9 781 aa13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC7A3Q8WY07 619 aa13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 NACC1Q96RE7 527 aa13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa13.66□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 EVPLQ92817 2033 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 DGAT1O75907 488 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 ACRP10323 421 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 ATP2B1P20020 1258 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 TECP42680 631 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 POU5F1BQ06416 359 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 BECN1Q14457 450 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 RAB30Q15771 203 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 ATL3Q6DD88 541 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF410Q86VK4 478 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 BANK1Q8NDB2 785 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 TCP11Q8WWU5 503 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 UIMC1Q96RL1 719 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 CDY2AQ9Y6F7 541 aa13.65□□□□□ -0.22
KCNQ1-203ENST00000345015 SCN5AQ14524 2016 aa13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 GPR182O15218 404 aa13.64□□□□□ -0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms