RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311034.6

NPAS4-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPAS4, Length 3,303 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS4-201ENST00000311034 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 CASZ1Q86V15 1759 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 LDHCP07864 332 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 H2AFZP0C0S5 128 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 ELF1P32519 619 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 SCTRP47872 440 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 H2AFVQ71UI9 128 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 BANK1Q8NDB2 785 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 GLG1Q92896 1179 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 PSMD1Q99460 953 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 SNX24Q9Y343 169 aa14.75□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 ZBTB39O15060 712 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 CAND2O75155 1236 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 FLOT1O75955 427 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 USP11P51784 963 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 MTM1Q13496 603 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 FUKQ8N0W3 1084 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 CPXCR1Q8N123 301 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 MREGQ8N565 214 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 VEZTQ9HBM0 779 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 RGL1Q9NZL6 768 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 BCORQ6W2J9 1755 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 COL4A1P02462 1669 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 TRAPPC3O43617 180 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 FMO2Q99518 471 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 NAGPAQ9UK23 515 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 MMEP08473 750 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 UCHL3P15374 230 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 CD302Q8IX05 232 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 PBKQ96KB5 322 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 NR2E1Q9Y466 385 aa14.74□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 SHBGP04278 402 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 CASP5P51878 434 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 MTMR3Q13615 1198 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 DOCK2Q92608 1830 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 PROM2Q8N271 834 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 MYCT1Q8N699 235 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 MTMR9Q96QG7 549 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 AZI2Q9H6S1 392 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 GCNT4Q9P109 453 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 AMFRQ9UKV5 643 aa14.73□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 NEBLO76041 1014 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 RSPH10BP0C881 870 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 CHN1P15882 459 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 ECHS1P30084 290 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 KCNA1Q09470 495 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 BIRC3Q13489 604 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 LRRC14Q15048 493 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 FAM84AQ96KN4 292 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 GGA1Q9UJY5 639 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 PSMD2Q13200 908 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 SEMA3FQ13275 785 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 AADACL2Q6P093 401 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 SGSM3Q96HU1 749 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.72□□□□□ -0.05
NPAS4-201ENST00000311034 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms