RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298282.13

PKNOX2-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX2, Length 3,687 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-201ENST00000298282 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 CSRNP1Q96S65 589 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 E9PMD0 336 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 PJA2O43164 708 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 MAP3K13O43283 966 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 GDF11O95390 407 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 TUBBP07437 444 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 C2orf54Q08AI8 447 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 KCNMA1Q12791 1236 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.68□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 POTEB3A0JP26 581 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 GOLGA6BA6NDN3 693 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 POTECB2RU33 542 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 KIF3CO14782 793 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 MSH4O15457 936 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 PPIP5K2O43314 1243 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 SMTNP53814 917 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 GIT2Q14161 759 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 POTEBQ6S5H4 581 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 B3GNT9Q6UX72 402 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 FAM184BQ9ULE4 1060 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 VAV2P52735 878 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 IFT88Q13099 833 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 PPP2R5CQ13362 524 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 FUKQ8N0W3 1084 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 SCLT1Q96NL6 688 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ATP8B3O60423 1300 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF263O14978 683 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 STAT2P52630 851 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 GPBP1Q86WP2 473 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC5A5Q92911 643 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 GOPCQ9HD26 462 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 STK32BQ9NY57 414 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.67□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 SHTN1A0MZ66 631 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 SPDYE3A6NKU9 549 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 KRT86O43790 486 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 PRLRP16471 622 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC7A5Q01650 507 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 NAA25Q14CX7 972 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 GJA10Q969M2 543 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 HSD17B14Q9BPX1 270 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 EPHB6O15197 1021 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 PSMD10O75832 226 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 NOL4O94818 638 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ADCY2Q08462 1091 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 PDXDC1Q6P996 788 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 FAM160B2Q86V87 743 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 TTLL6Q8N841 843 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 CCDC26Q8TAB7 109 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 ETAA1Q9NY74 926 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 CEP72Q9P209 647 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 RCCD1A6NED2 376 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 EYA4O95677 639 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 IDEP14735 1019 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 RDXP35241 583 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 QPCTQ16769 361 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 HGSNATQ68CP4 663 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 C6orf89Q6UWU4 347 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 EHD2Q9NZN4 543 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.66□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 LSP1P33241 339 aa11.65□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 HOXD13P35453 343 aa11.65□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 PRR16Q569H4 304 aa11.65□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
PKNOX2-201ENST00000298282 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms