RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 SLFN12Q8IYM2 578 aa27.56■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 LRRC37AA6NMS7 1700 aa27.56■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 PRKCIP41743 596 aa27.55■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 GGA2Q9UJY4 613 aa27.55■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC188H7C350 402 aa27.55■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa27.55■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 FBXL5Q9UKA1 691 aa27.55■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 SCNN1DP51172 638 aa27.54■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 SPIRE1Q08AE8 756 aa27.54■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 IFT88Q13099 833 aa27.54■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 GIT2Q14161 759 aa27.54■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 MOXD1Q6UVY6 613 aa27.54■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 RUFY4Q6ZNE9 571 aa27.54■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 LMBR1Q8WVP7 490 aa27.54■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 MXD3Q9BW11 206 aa27.54■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 28e-6■□□□□ 10.9
CTBP1-201ENST00000290921 SLURP2P0DP57 97 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 ITGA4P13612 1032 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 FLT3P36888 993 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 PPARDQ03181 441 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 BIRC3Q13489 604 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 CATSPER3Q86XQ3 398 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 SP8Q8IXZ3 490 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 CABS1Q96KC9 395 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 AMACRQ9UHK6 382 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 NENFQ9UMX5 172 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 H2AFZP0C0S5 128 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 HOXD13P35453 343 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 EPHA7Q15375 998 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 H2AFVQ71UI9 128 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 SLFN11Q7Z7L1 901 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 SFR1Q86XK3 245 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 RASGEF1CQ8N431 466 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 ETNPPLQ8TBG4 499 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 CYFIP2Q96F07 1278 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC17Q96LX7 622 aa27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 DAPK3O43293 454 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 PSMC6P62333 389 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 AP3B2Q13367 1082 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 CRYGNQ8WXF5 182 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 GMNCA6NCL1 334 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 MEIS2O14770 477 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 CALUO43852 315 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 RAD21O60216 631 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 DDR1Q08345 913 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 MTMR3Q13615 1198 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 TCERG1LQ5VWI1 586 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 C6orf89Q6UWU4 347 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 VPS36Q86VN1 386 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 SIX2Q9NPC8 291 aa27.52■■■□□ 2
CTBP1-201ENST00000290921 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 AKAP3O75969 853 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 ANXA13P27216 316 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 ARHGAP4P98171 946 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 NFIAQ12857 509 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 DAAM2Q86T65 1068 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 DNAJC18Q9H819 358 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 MEIS1O00470 390 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 PDXKO00764 312 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.995e-10■□□□□ 8.9
CTBP1-201ENST00000290921 PRR16Q569H4 304 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 ODF2Q5BJF6 829 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC26Q8TAB7 109 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 DCAF4Q8WV16 495 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 REEP2Q9BRK0 252 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 USP21Q9UK80 565 aa27.51■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 TMOD1P28289 359 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 JAM2P57087 298 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 AGBL2Q5U5Z8 902 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 SYCE1Q8N0S2 351 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 ERMNQ8TAM6 284 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 VCPKMTQ9H867 229 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 ATP8B3O60423 1300 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.993e-8■■■■■ 30.5
CTBP1-201ENST00000290921 TTI1O43156 1089 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 EEF2P13639 858 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 GJB7Q6PEY0 223 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 HHIPL2Q6UWX4 724 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 NT5DC3Q86UY8 548 aa27.5■■□□□ 1.99
CTBP1-201ENST00000290921 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
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