RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 OSGEPQ9NPF4 335 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 PNMA2Q9UL42 364 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 POTEFA5A3E0 1075 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CAND2O75155 1236 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 POTEIP0CG38 1075 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 PRKCIP41743 596 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 NOVP48745 357 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 POTEGQ6S5H5 508 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CCT6BQ92526 530 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 USP21Q9UK80 565 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 F8W031 263 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 MED24O75448 989 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 COPB2P35606 906 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.855e-6■■■■■ 35.2
CNIH3-201ENST00000272133 NFIXQ14938 502 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 WLSQ5T9L3 541 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 HES6Q96HZ4 224 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 FMO2Q99518 471 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 NYXQ9GZU5 481 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 AKAP3O75969 853 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 HOXD13P35453 343 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 TLCD1Q96CP7 247 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 HVCN1Q96D96 273 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SIX2Q9NPC8 291 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.34■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 BTAF1O14981 1849 aa20.33■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SHBGP04278 402 aa20.33■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 RFC4P35249 363 aa20.33■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SLC12A3P55017 1021 aa20.33■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 EPHA7Q15375 998 aa20.33■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.33■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.33■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CUL5Q93034 780 aa20.33■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 NHSQ6T4R5 1651 aa20.33■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.33■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 SLC16A2P36021 539 aa20.33■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.33■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.33■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 GCNT4Q9P109 453 aa20.33■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PPFIA2O75334 1257 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 GFPT2O94808 682 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 CASP4P49662 377 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 GALCP54803 685 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 JAM2P57087 298 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 RPAINQ86UA6 219 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ELF1P32519 619 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 RHBDL3P58872 404 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PSMC6P62333 389 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 XRCC4Q13426 336 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 E2F5Q15329 346 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 VPS36Q86VN1 386 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 SFR1Q86XK3 245 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 GOPCQ9HD26 462 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 MEIS1O00470 390 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 C21orf2O43822 256 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 SNHG28P0DPA3 235 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 NF2P35240 595 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 SWAP70Q9UH65 585 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 AMFRQ9UKV5 643 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L15C9J2P7 530 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms