RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269740.8

SLC39A3-201, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC39A3, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-201ENST00000269740 INSRRP14616 1297 aa26.59■■□□□ 1.85
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SLC39A3-201ENST00000269740 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SLC39A3-201ENST00000269740 NBPF20Q3BBV1 942 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC39A3-201ENST00000269740 XKR9Q5GH70 373 aa26.59■■□□□ 1.85
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SLC39A3-201ENST00000269740 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC39A3-201ENST00000269740 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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SLC39A3-201ENST00000269740 PPFIA1Q13136 1202 aa26.57■■□□□ 1.84
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SLC39A3-201ENST00000269740 NPEPPSP55786 919 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 CHMP4BP1P59074 171 aa26.56■■□□□ 1.84
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SLC39A3-201ENST00000269740 SV2BQ7L1I2 683 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 SLC43A3Q8NBI5 491 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 ABHD8Q96I13 439 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 CEP89Q96ST8 783 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 TMEM150BA6NC51 233 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
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SLC39A3-201ENST00000269740 SLC12A3P55017 1021 aa26.55■■□□□ 1.84
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SLC39A3-201ENST00000269740 MTERF2Q49AM1 385 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.55■■□□□ 1.84
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SLC39A3-201ENST00000269740 RFC5P40937 340 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 MCM6Q14566 821 aa26.55■■□□□ 1.84
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SLC39A3-201ENST00000269740 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 EVPLQ92817 2033 aa26.54■■□□□ 1.84
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SLC39A3-201ENST00000269740 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 ADAM17P78536 824 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 AMPD3Q01432 767 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.54■■□□□ 1.84
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SLC39A3-201ENST00000269740 CNNM3Q8NE01 707 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 LMBR1Q8WVP7 490 aa26.54■■□□□ 1.84
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SLC39A3-201ENST00000269740 NECAB2Q7Z6G3 386 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
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SLC39A3-201ENST00000269740 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.53■■□□□ 1.84
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SLC39A3-201ENST00000269740 PDLIM7Q9NR12 457 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SLC39A3-201ENST00000269740 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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SLC39A3-201ENST00000269740 CYP11B2P19099 503 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC39A3-201ENST00000269740 EN2P19622 333 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SLC39A3-201ENST00000269740 KLRC1P26715 233 aa26.51■■□□□ 1.83
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