RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-201ENST00000263054 PNMA3Q9UL41 463 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 PGBD3Q8N328 593 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 TTC17Q96AE7 1141 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 BHMT2Q9H2M3 363 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 PCSK1NQ9UHG2 260 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 CLDN3O15551 220 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 COPB2P35606 906 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 LMNB2Q03252 620 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SLC44A5Q8NCS7 719 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 OSBP2Q969R2 916 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 E5RI56 91 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 DNAJC6O75061 913 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 NDFIP2Q9NV92 336 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SLC16A4O15374 487 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SUN1O94901 812 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 MMP1P03956 469 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 CYP21A2P08686 494 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 TCP1P17987 556 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 MXI1P50539 228 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF699Q32M78 642 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 KRT10P13645 584 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 PIGBQ92521 554 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 USP17L15C9J2P7 530 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 USP17L11C9JVI0 530 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 USP17L18D6R9N7 530 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 USP17L22D6RA61 530 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 USP17L19D6RCP7 530 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 USP17L20D6RJB6 530 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 USP17L24Q0WX57 530 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 RASEFQ8IZ41 740 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SWSAP1Q6NVH7 229 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SSH3Q8TE77 659 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 LZICQ8WZA0 190 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 BBOX1O75936 387 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 HMBSP08397 361 aa15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 POTEMA6NI47 508 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 BRD1O95696 1058 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 BBOF1Q8ND07 529 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SLC13A1Q9BZW2 595 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SH3KBP1Q96B97 665 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 MAN2A1Q16706 1144 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 RAET1EQ8TD07 263 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SPATA33Q96N06 139 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SPON2Q9BUD6 331 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 ABCC12Q96J65 1359 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 GPC3P51654 580 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SAAL1Q96ER3 474 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SAMD9Q5K651 1589 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 GCLMP48507 274 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SNCBQ16143 134 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 TMEM270Q6UE05 265 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 CEP19Q96LK0 163 aa15.43■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 CPB1P15086 417 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 UBE3CQ15386 1083 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 TMEM94Q12767 1356 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 RFWD2Q8NHY2 731 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC78A2IDD5 438 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SOX11P35716 441 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 GRIK1P39086 918 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 FAN1Q9Y2M0 1017 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 FAM180AQ6UWF9 173 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 CDHR1Q96JP9 859 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.42■□□□□ 0.06
SORCS1-201ENST00000263054 SERPING1P05155 500 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms