RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 AP3B2Q13367 1082 aa20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 USP38Q8NB14 1042 aa20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 ADRA2BP18089 450 aa20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 DYDC2Q96IM9 177 aa20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 VEZTQ9HBM0 779 aa20.1■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 ZBTB39O15060 712 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 SNHG28P0DPA3 235 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 KRT71Q3SY84 523 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 DCAF4Q8WV16 495 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 FGGP02679 453 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 RPA1P27694 616 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 ALDH1B1P30837 517 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 CLRN2A0PK11 232 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 EDIL3O43854 480 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 CETN1Q12798 172 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 TTMPQ5BVD1 217 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 WHAMMQ8TF30 809 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.09■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 MSH4O15457 936 aa20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 LCA5LO95447 670 aa20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 DAPK3O43293 454 aa20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 SLC12A3P55017 1021 aa20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 ITIH3Q06033 890 aa20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 PBKQ96KB5 322 aa20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LRP3-201ENST00000253193 ABCA3Q99758 1704 aa20.08■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 PDXKO00764 312 aa20.08■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 CCDC172P0C7W6 258 aa20.08■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 MICALCLQ6ZW33 695 aa20.08■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.08■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 PARVGQ9HBI0 331 aa20.08■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.08■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.08■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 MNAT1P51948 309 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 SEC24CP53992 1094 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 CRY2Q49AN0 593 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 METTL13Q8N6R0 699 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 HOOK2Q96ED9 719 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 MEIS2O14770 477 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 FERP16591 822 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 FAM20AQ96MK3 541 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 BACH1O14867 736 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 COPB2P35606 906 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.07■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 GALCP54803 685 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 GRIN2DO15399 1336 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 EVI5O60447 810 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 CCDC25Q86WR0 208 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 CPXCR1Q8N123 301 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 POLR2MP0CAP2 368 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 ITGA4P13612 1032 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 GANQ9H2C0 597 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 A0A1B0GUL6 1792 aa20.06■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 TTI1O43156 1089 aa20.05■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LRP3-201ENST00000253193 COG2Q14746 738 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms