RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
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HOXD9-201ENST00000249499 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC122Q5T0U0 273 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD9-201ENST00000249499 NSMFQ6X4W1 530 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD9-201ENST00000249499 C4orf19Q8IY42 314 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD9-201ENST00000249499 CEP112Q8N8E3 955 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD9-201ENST00000249499 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
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HOXD9-201ENST00000249499 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD9-201ENST00000249499 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD9-201ENST00000249499 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD9-201ENST00000249499 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.14■■□□□ 1.62
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HOXD9-201ENST00000249499 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
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HOXD9-201ENST00000249499 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 PADI6Q6TGC4 694 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.14■■□□□ 1.61
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HOXD9-201ENST00000249499 STRA6Q9BX79 667 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 AKAP3O75969 853 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 ODR4Q5SWX8 454 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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HOXD9-201ENST00000249499 NLRX1Q86UT6 975 aa25.13■■□□□ 1.61
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HOXD9-201ENST00000249499 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.13■■□□□ 1.61
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HOXD9-201ENST00000249499 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 MYO6Q9UM54 1294 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 SFI1A8K8P3 1242 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 WDR64B1ANS9 1081 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 STAM2O75886 525 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 MAPK7Q13164 816 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 LRRN4CLQ8ND94 238 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 RNF181Q9P0P0 153 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 FBXL5Q9UKA1 691 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 RIPK3Q9Y572 518 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 HIP1RO75146 1068 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 PPP1R37O75864 691 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 ABL1P00519 1130 aa25.12■■□□□ 1.61
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HOXD9-201ENST00000249499 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 RARRES1P49788 294 aa25.12■■□□□ 1.61
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HOXD9-201ENST00000249499 KIF5AQ12840 1032 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.12■■□□□ 1.61
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HOXD9-201ENST00000249499 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.12■■□□□ 1.61
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HOXD9-201ENST00000249499 WNK4Q96J92 1243 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 DEF6Q9H4E7 631 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 SAMM50Q9Y512 469 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 SERPING1P05155 500 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 ERCC3P19447 782 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 PSMC5P62195 406 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 BORCS6Q96GS4 357 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 CDHR1Q96JP9 859 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 GBP3Q9H0R5 595 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 GANQ9H2C0 597 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 ACAD9Q9H845 621 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 DMAC2Q9NW81 257 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 NR3C2P08235 984 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 KCNA1Q09470 495 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 HGSNATQ68CP4 663 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 DAW1Q8N136 415 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 ANO9A1A5B4 782 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 AKR1B10O60218 316 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD9-201ENST00000249499 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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