RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B DFG16Q99234 619 aa0.57□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B COS2P0CX12 379 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B COS3P0CX13 379 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YPK1P12688 680 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SEN2P16658 377 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ANB1P19211 157 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS33P20795 691 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PRP19P32523 503 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B IME2P32581 645 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TCA17P32613 152 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B IES6P32617 166 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B CLB6P32943 380 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TOM20P35180 183 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ASK1P35734 292 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS51P36116 164 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ASC1P38011 319 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NRG2P38082 220 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YBR241CP38142 488 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MAL33P38157 468 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B INM1P38710 295 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B CTR2P38865 189 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YER084WP40057 128 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YNL200CP40165 246 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NDE1P40215 560 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NTA1P40354 457 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TDA10P42938 290 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B COS4P43542 379 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B COS5P47187 383 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TAF4P50105 388 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TEL2P53038 688 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GEP7P53171 287 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B BUD9P53226 547 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MPA43P53583 542 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NCE103P53615 221 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS9P54787 451 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YDR274CP87283 123 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YPL039WQ03080 316 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B BUD22Q04347 519 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PAL1Q05518 499 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MRX10Q05648 414 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR287CQ05881 355 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TDA5Q06417 326 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR195CQ06594 109 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SSK1Q07084 712 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B COS7Q07788 383 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B FRA1Q07825 749 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RRP40Q08285 240 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YDL176WQ12027 708 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YPS3Q12303 508 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MMP1Q12372 583 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SWM1Q12379 170 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MRX4Q12467 430 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MHF1Q3E835 90 aa0.56□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TDH1P00360 332 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B FLP1P03870 423 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SCEIP03882 235 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS31P05759 152 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PEP5P12868 1029 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B KSS1P14681 368 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GRX2P17695 143 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS1P21576 704 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B VMA4P22203 233 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B DAL2P25335 343 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GUT2P32191 649 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GLC7P32598 312 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B FBP26P32604 452 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GYP6P32806 458 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YME2P32843 850 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TIP20P33891 701 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B CSG2P35206 410 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SPT10P35208 640 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SET3P36124 751 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TAT1P38085 619 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MAK5P38112 773 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ARN1P38731 627 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B HSE1P38753 452 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B BCD1P38772 366 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TRR2P38816 342 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YHR218WP38899 603 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GGC1P38988 300 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ATM1P40416 690 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MVP1P40959 511 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B AIM22P47051 409 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B BNA2P47125 453 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PHB2P50085 310 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MAL13P53338 473 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SIW14P53965 281 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NAN1Q02931 896 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SVL3Q03088 825 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B URH1Q04179 340 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NAT4Q04751 285 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SPR28Q04921 423 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NUT2Q06213 157 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B STP4Q07351 490 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NTG2Q08214 380 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SGT1Q08446 395 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YOR365CQ08844 703 aa0.55□□□□□ -2.32
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