RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	YPS7	Q06325	596 aa		3.04	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	MCH5	Q08777	521 aa		3.04	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	ATX2	Q12067	313 aa		3.04	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	MDY2	Q12285	212 aa		3.04	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	ZRT2	Q12436	422 aa		3.04	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	DIF1	O13577	133 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	CDC9	P04819	755 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PPH22	P23595	377 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	CTS1	P29029	562 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	NUP2	P32499	720 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	APN2	P38207	520 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	MMS4	P38257	691 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	BIG1	P38813	335 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	IKI1	P38874	309 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YGR201C	P42936	225 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SER2	P42941	309 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YJR056C	P47115	236 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YJR154W	P47181	346 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	POP6	P53218	158 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	UBX4	P54730	416 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SLD5	Q03406	294 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YAP6	Q03935	383 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YMR253C	Q04835	414 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YLR283W	Q05867	314 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	ADY4	Q05955	493 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YOR342C	Q12182	319 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YOR022C	Q12204	715 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	ECM3	Q99252	613 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RAD7	P06779	565 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PRB1	P09232	635 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	MNE1	P24720	663 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YCL002C	P25565	263 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	CDC20	P26309	610 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	ATP7	P30902	174 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SIP1	P32578	815 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RIB5	P38145	238 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	POP8	P38208	133 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RBG1	P39729	369 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YIR035C	P40579	254 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YML6	P51998	286 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	MRH4	P53166	561 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	COG5	P53951	403 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YPL014W	Q02606	381 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	TDA1	Q03533	586 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	GTO3	Q04806	366 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	TMA10	Q06177	86 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	TY4B-J	P47024	1803 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	GAL80	P04387	435 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	MSF1	P08425	469 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SPS4	P09937	338 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	RAD18	P10862	487 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	URA6	P15700	204 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	PRE8	P23639	250 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	NGG1	P32494	702 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	ECM25	P32525	599 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	BEM3	P32873	1128 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	GUF1	P46943	645 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	CPR7	P47103	393 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	MRX6	P48564	524 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	GND2	P53319	492 aa		3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
DOA4	YDR069C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93

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