RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612286.4

HOXA3-207, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA3, Length 3,396 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-207ENST00000612286 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 RFC4P35249 363 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SNX1Q13596 522 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PARP10Q53GL7 1025 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 RAB34Q9BZG1 259 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TMBIM4Q9HC24 238 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SPEF2Q9C093 1822 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 KIF1AQ12756 1690 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 GJC1P36383 396 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PPP2R2AP63151 447 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SKOR1P84550 965 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SFR1Q86XK3 245 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CEP89Q96ST8 783 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 GCNT4Q9P109 453 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 BAG3O95817 575 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 MMEP08473 750 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 COL4A1P02462 1669 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 A0A1W2PQJ5 194 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 GNPATO15228 680 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ACSL3O95573 720 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CHN1P15882 459 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PLCG2P16885 1265 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 BTBD6Q96KE9 485 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 FAM167BQ9BTA0 163 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 VCPKMTQ9H867 229 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 UCHL3P15374 230 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 MTM1Q13496 603 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 FAM182AQ5T1J6 154 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 NSMFQ6X4W1 530 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SCFD1Q8WVM8 642 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CEP83Q9Y592 693 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 M0R2N6 131 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CHUKO15111 745 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SCTRP47872 440 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 FAM84AQ96KN4 292 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 AK8Q96MA6 479 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TAS2R14Q9NYV8 317 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 RGL1Q9NZL6 768 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CALCAP01258 141 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 H2AFZP0C0S5 128 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 AKR1B1P15121 316 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 H2AFVQ71UI9 128 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PALB2Q86YC2 1186 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 WHAMMQ8TF30 809 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 LRRC45Q96CN5 670 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ERVK-5Q9HDB9 667 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TRIM33Q9UPN9 1127 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 NID2Q14112 1375 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 A8MUI8 341 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 MARCKSL1P49006 195 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 COG2Q14746 738 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 FUKQ8N0W3 1084 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 FMO2Q99518 471 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 NAGPAQ9UK23 515 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 EZRP15311 586 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 LRRC63Q05C16 580 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 C18orf8Q96DM3 657 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 MTA3Q9BTC8 594 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 BHMT2Q9H2M3 363 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PCIF1Q9H4Z3 704 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 UFL1O94874 794 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CREB1P16220 341 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 GALCP54803 685 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXA3-207ENST00000612286 C2CD6Q53TS8 623 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms