RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592763.5

ILF3-222, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ILF3, Length 3,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-222	ENST00000592763	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	PXMP2	Q9NR77	195 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	BIRC3	Q13489	604 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	MFAP3L	O75121	409 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	PSAP	P07602	524 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	FDX1	P10109	184 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF18	P17022	549 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	TTI2	Q6NXR4	508 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	CEP89	Q96ST8	783 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	ZBTB22	O15209	634 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	PHACTR2	O75167	634 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	KRT76	Q01546	638 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	TRIM14	Q14142	442 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	GIT2	Q14161	759 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	CDHR1	Q96JP9	859 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	CHP1	Q99653	195 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	NR3C1	P04150	777 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	CASP5	P51878	434 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	PSMC5	P62195	406 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	STRN3	Q13033	797 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	CCL15	Q16663	113 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	SPATA20	Q8TB22	786 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	INTS13	Q9NVM9	706 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	MYH1	P12882	1939 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	HERVK_113	P62684	666 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	TC2N	Q8N9U0	490 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	MMP19	Q99542	508 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	RIT2	Q99578	217 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	NUP58	Q9BVL2	599 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	GAP43	P17677	238 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC181	Q5TID7	509 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	VPS36	Q86VN1	386 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	FBXO40	Q9UH90	709 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	USP20	Q9Y2K6	914 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ILF3-222	ENST00000592763	PIK3CD	O00329	1044 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	GGPS1	O95749	300 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	GYPC	P04921	128 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	HUNK	P57058	714 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	KCNH2	Q12809	1159 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	TMEM143	Q96AN5	459 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	FNBP1	Q96RU3	617 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	TFR2	Q9UP52	801 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	LRRN2	O75325	713 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	MMP14	P50281	582 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	KRT83	P78385	493 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	CCNA1	P78396	465 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	SAAL1	Q96ER3	474 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	KRT86	O43790	486 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	TNNI1	P19237	187 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	LIG4	P49917	911 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	JAK3	P52333	1124 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ILF3-222	ENST00000592763	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51

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