RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-208ENST00000589104 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.71□□□□□ -0.05
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KDM4B-208ENST00000589104 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.69□□□□□ -0.06
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KDM4B-208ENST00000589104 VCPKMTQ9H867 229 aa14.69□□□□□ -0.06
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KDM4B-208ENST00000589104 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 LIG3P49916 1009 aa14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 GNGT1P63211 74 aa14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 KCNH2Q12809 1159 aa14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 KIF22Q14807 665 aa14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 14.4
KDM4B-208ENST00000589104 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 28.2
KDM4B-208ENST00000589104 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
KDM4B-208ENST00000589104 CCDC188H7C350 402 aa14.68□□□□□ -0.06
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