RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP22-211	ENST00000584538	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP22-211	ENST00000584538	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP22-211	ENST00000584538	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP22-211	ENST00000584538	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP22-211	ENST00000584538	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP22-211	ENST00000584538	CEP290	O15078	2479 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP22-211	ENST00000584538	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	LAD1	O00515	517 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	HBP1	O60381	514 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	LYPLA2	O95372	231 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	C22orf31	O95567	290 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	BRD1	O95696	1058 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	PTK7	Q13308	1070 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	GDF15	Q99988	308 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	LXN	Q9BS40	222 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	TIMP1	P01033	207 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	CYP2C18	P33260	490 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	PSMC5	P62195	406 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	GPNMB	Q14956	572 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	ANO5	Q75V66	913 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	CLIC4	Q9Y696	253 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	TCHH	Q07283	1943 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	MARCH6	O60337	910 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	MED24	O75448	989 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	SLITRK3	O94933	977 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	TEC	P42680	631 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	EPHB4	P54760	987 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	IGBP1	P78318	339 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	GRIN1	Q05586	938 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	MGAT3	Q09327	533 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	XKR3	Q5GH77	459 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	BAD	Q92934	168 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	GBF1	Q92538	1859 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	CAND2	O75155	1236 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	BMP15	O95972	392 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	GNAT1	P11488	350 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	CKB	P12277	381 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	RAG1	P15918	1043 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	ECM1	Q16610	540 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	ZBTB39	O15060	712 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	CSF2RA	P15509	400 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	CCL23	P55773	120 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	BFSP2	Q13515	415 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP22-211	ENST00000584538	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.29	□□□□□ -0.28

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