RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 NACC1Q96RE7 527 aa12.88□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 CUEDC2Q9H467 287 aa12.88□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ERAP1Q9NZ08 941 aa12.88□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 STK17AQ9UEE5 414 aa12.88□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 OGDHLQ9ULD0 1010 aa12.88□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 KIAA1024Q9UPX6 916 aa12.88□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 MOXD2PA6NHM9 499 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 H3BRB1 525 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 HAS3O00219 553 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 SGPL1O95470 568 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 PLCG1P19174 1290 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 SYKP43405 635 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 NAALADL2Q58DX5 795 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 XKR3Q5GH77 459 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 RRAGBQ5VZM2 374 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 POTEGQ6S5H5 508 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 IQUBQ8NA54 791 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 KAT2BQ92831 832 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 GLG1Q92896 1179 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 FAM167AQ96KS9 214 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 DEFB118Q96PH6 123 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ANKEF1Q9NU02 776 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 DNM3Q9UQ16 869 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 KAT6AQ92794 2004 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ARID2Q68CP9 1835 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 CABYRO75952 493 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ZNF202O95125 648 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 EYA4O95677 639 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 OATP04181 439 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ZNF286BP0CG31 522 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 LIG1P18858 919 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 YWHABP31946 246 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 PSMC6P62333 389 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 PRKCEQ02156 737 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 PLCB4Q15147 1175 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 KCNA10Q16322 511 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ANO5Q75V66 913 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 OTUD6AQ7L8S5 288 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 KCNK18Q7Z418 384 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 TRIM50Q86XT4 487 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 RASSF8Q8NHQ8 419 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ATP8B4Q8TF62 1192 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 LRRC15Q8TF66 581 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 RAD54LQ92698 747 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 TIGD1Q96MW7 591 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 KATNAL1Q9BW62 490 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 MAGEF1Q9HAY2 307 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 NRBP2Q9NSY0 501 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 PPME1Q9Y570 386 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 DNM1LO00429 736 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 HBP1O60381 514 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 NR1I2O75469 434 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 MBD3O95983 291 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ASGR1P07306 291 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 MYL3P08590 195 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 SLFN14P0C7P3 912 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 STAT6P42226 847 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 GJA8P48165 433 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 NFKBIBQ15653 356 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 PDILTQ8N807 584 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ANKLE1Q8NAG6 615 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 PIGOQ8TEQ8 1089 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 PANK2Q9BZ23 570 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 KBTBD4Q9NVX7 518 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 PHF24Q9UPV7 400 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 COL1A2P08123 1366 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 E9PMD0 336 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ZBTB39O15060 712 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 RARRES1P49788 294 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 PSEN2P49810 448 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ACLYP53396 1101 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 SLC12A3P55017 1021 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 MFSD10Q14728 455 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 KIAA0753Q2KHM9 967 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 LONRF3Q496Y0 759 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 ZNF484Q5JVG2 852 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 KANK3Q6NY19 840 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 CXCL17Q6UXB2 119 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 KRBA2Q6ZNG9 492 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 CKAP2LQ8IYA6 745 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-211ENST00000582232 GPT2Q8TD30 523 aa12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms