RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580127.5

MKS1-209, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5

Gene MKS1, Length 843 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-209ENST00000580127 AAASQ9NRG9 546 aa20.42■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 PADI3Q9ULW8 664 aa20.42■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 SCG2P13521 617 aa20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 LTBRP36941 435 aa20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 HYAL1Q12794 435 aa20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 PLCB4Q15147 1175 aa20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 NECTIN1Q15223 517 aa20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 KCNH6Q9H252 994 aa20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 CD207Q9UJ71 328 aa20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.41■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 BACH1O14867 736 aa20.4■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 HBP1O60381 514 aa20.4■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.4■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 ADAM15Q13444 863 aa20.4■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 MCTP2Q6DN12 878 aa20.4■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.4■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.4■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
MKS1-209ENST00000580127 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 SMCO2A6NFE2 343 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 MEIS1O00470 390 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 NDUFV1P49821 464 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 AP3B2Q13367 1082 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 NEK1Q96PY6 1258 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 PCYT2Q99447 389 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.39■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 FSD2A1L4K1 749 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 DENND3A2RUS2 1198 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 STXBP3O00186 592 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 ZBTB43O43298 467 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 MBTPS2O43462 519 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 ATG7O95352 703 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 LINC00271P0C7V0 271 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 KLRC1P26715 233 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 CLUL1Q15846 466 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 RTN1Q16799 776 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.38■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 GPR182O15218 404 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 RPS6KA5O75582 802 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 ARP10275 920 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 FGD1P98174 961 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 APOA5Q6Q788 366 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 ANO3Q9BYT9 981 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 GINS2Q9Y248 185 aa20.37■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 ITGB1P05556 798 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 IRS1P35568 1242 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 SREBF1P36956 1147 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 UBE3AQ05086 875 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 KRT32Q14532 448 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 EFHBQ8N7U6 833 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 TLE6Q9H808 572 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 ZNF302Q9NR11 478 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 BARHL2Q9NY43 387 aa20.36■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 COL1A2P08123 1366 aa20.35■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 CSPG5O95196 566 aa20.35■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.35■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.35■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.35■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.35■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 POF1BQ8WVV4 589 aa20.35■□□□□ 0.85
MKS1-209ENST00000580127 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms