RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 RB1P06400 928 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 STAG3L1P0CL83 205 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 EVCP57679 992 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 LPIN1Q14693 890 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 EPC2Q52LR7 807 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF484Q5JVG2 852 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 PDXDC2PQ6P474 469 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 ABHD15Q6UXT9 468 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 CKAP2LQ8IYA6 745 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 ATP8B4Q8TF62 1192 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 PCYT2Q99447 389 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.85■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 FAM86B1E9PN63 330 aa18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 PSAPP07602 524 aa18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 FAM86B2P0C5J1 330 aa18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 PAK2Q13177 524 aa18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM192Q8IY95 271 aa18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF710Q8N1W2 664 aa18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 PHKBQ93100 1093 aa18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 C17orf80Q9BSJ5 609 aa18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.84■□□□□ 0.61
SPNS1-211ENST00000568829 H3BNC9 293 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 ENPP3O14638 875 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 BMP1P13497 986 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 USP11P51784 963 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 NLRP5P59047 1200 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 GPM6BQ13491 265 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PKN1Q16512 942 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 KRT40Q6A162 431 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 FAM167AQ96KS9 214 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 TM6SF1Q9BZW5 370 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 SAMM50Q9Y512 469 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 MICAL3Q7RTP6 2002 aa18.83■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 NCK2O43639 380 aa18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 KLRC1P26715 233 aa18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CIITAP33076 1130 aa18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 TFF2Q03403 129 aa18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PRR16Q569H4 304 aa18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 GALNT17Q6IS24 598 aa18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 SWSAP1Q6NVH7 229 aa18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 LMAN2LQ9H0V9 348 aa18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 COL4A6Q14031 1691 aa18.82■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 WDR64B1ANS9 1081 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 MAGEB2O15479 319 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CDKL5O76039 1030 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 DEXIO95424 95 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 XBP1P17861 261 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 TMOD1P28289 359 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CD52P31358 61 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 NTRK3Q16288 839 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 SPRED2Q7Z698 418 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PLVAPQ9BX97 442 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 TRANK1O15050 2925 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PTPRSQ13332 1948 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 GPR182O15218 404 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CCNE2O96020 404 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 SFNP31947 248 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CTNNB1P35222 781 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 NPAS4Q8IUM7 802 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PPP2R3CQ969Q6 453 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 PADI3Q9ULW8 664 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 FAM50BQ9Y247 325 aa18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 C5orf67F2Z3F1 127 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 RPS6KA5O75582 802 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 BMPR1AP36894 532 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 KCNQ1P51787 676 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 NAALADL2Q58DX5 795 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 BANK1Q8NDB2 785 aa18.79■□□□□ 0.6
SPNS1-211ENST00000568829 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms