RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568514.5

SNAP23-218, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 3

Gene SNAP23, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-218	ENST00000568514	MPIG6B	O95866	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	NFKB2	Q00653	900 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	GJA9	P57773	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	KIAA0556	O60303	1618 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	SHROOM2	Q13796	1616 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	CLIP1	P30622	1438 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SNAP23-218	ENST00000568514	MAFK	O60675	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MME	P08473	750 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ST5	P78524	1137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CRY1	Q16526	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ABCC2	Q92887	1545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KIF21B	O75037	1637 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	TRAF5	O00463	557 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KCNQ2	O43526	872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	B4GALT4	O60513	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ASMTL	O95671	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	SYN1	P17600	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	IL13RA1	P78552	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PLP2	Q04941	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514		M0R2C6	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PLD2	O14939	933 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ITGB3	P05106	788 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CELA3B	P08861	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ADCY8	P40145	1251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	TBR1	Q16650	682 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	DLG3	Q92796	817 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CD109	Q6YHK3	1445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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