RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITGB5P18084 799 aa23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VCAM1P19320 739 aa23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF131P52739 623 aa23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNH2Q12809 1159 aa23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTMR2Q13614 643 aa23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LXNQ9BS40 222 aa23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COL20A1Q9P218 1284 aa23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GUCY2CP25092 1073 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLCN6P51797 869 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AMPD2Q01433 879 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JADE2Q9NQC1 790 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ASTN1O14525 1302 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANO9A1A5B4 782 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NOL4O94818 638 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SERPING1P05155 500 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP27A1Q02318 531 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TKFCQ3LXA3 575 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PICK1Q9NRD5 415 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTAGE8P0CG41 777 aa23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DOCK1Q14185 1865 aa23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RCCD1A6NED2 376 aa23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF263O14978 683 aa23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RASSF7Q02833 373 aa23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TACC1O75410 805 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGEA1P43355 309 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BACE1P56817 501 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPP2Q13103 211 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTMR1Q13613 665 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BANK1Q8NDB2 785 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM58Q8NG06 486 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL31RAQ8NI17 732 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SFI1A8K8P3 1242 aa23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AKAP3O75969 853 aa23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NMT1P30419 496 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HGSNATQ68CP4 663 aa23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GANQ9H2C0 597 aa23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms