RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 PADI3Q9ULW8 664 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 PCDHA6Q9UN73 950 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIAA1671Q9BY89 1806 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 EYA4O95677 639 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 SCG2P13521 617 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 RXRAP19793 462 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 CRIPAKQ8N1N5 446 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 EFHBQ8N7U6 833 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 EDAQ92838 391 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAP4K1Q92918 833 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa19.77■□□□□ 0.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 CALM1P0DP23 149 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 CALM2P0DP24 149 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 CALM3P0DP25 149 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 MCM5P33992 734 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 NRIP1P48552 1158 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC82Q8N4S0 544 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM87BQ96K49 555 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 SDF4Q9BRK5 362 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCNH7Q9NS40 1196 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 CLEC1BQ9P126 229 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 GATMP50440 423 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 STAT5BP51692 787 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 COASYQ13057 564 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLCB4Q15147 1175 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMRP1Q8NCR6 262 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF318Q5VUA4 2279 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPFIA3O75145 1194 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 ACTR2P61160 394 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRT76Q01546 638 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM266Q2M3C6 531 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 MXRA8Q9BRK3 442 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC12A7Q9Y666 1083 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 NFASCO94856 1347 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 C5orf42Q9H799 3197 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 SARSP49591 514 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 MTHFD1LQ6UB35 978 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIM67Q6ZTA4 783 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 NME8Q8N427 588 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 PBXIP1Q96AQ6 731 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMX1Q9H3N1 280 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 TLE6Q9H808 572 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 GINS2Q9Y248 185 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 TECTAO75443 2155 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM221A6NGB7 291 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 LOC730098B7Z3J9 87 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 M0R296 226 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 GLP2RO95838 553 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 LIFRP42702 1097 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMTC3Q6ZXV5 915 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 CYP2W1Q8TAV3 490 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 AAASQ9NRG9 546 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARP10275 920 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC26A2P50443 739 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBE3AQ05086 875 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 MICU3Q86XE3 530 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 FANCBQ8NB91 859 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 PGBD1Q96JS3 809 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 DENND3A2RUS2 1198 aa19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 TBKBP1A7MCY6 615 aa19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 PER2O15055 1255 aa19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPS6KA5O75582 802 aa19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 KLRC1P26715 233 aa19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZXDAP98168 799 aa19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 PKN1Q16512 942 aa19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERVK-5Q9HDB9 667 aa19.7■□□□□ 0.74
USP3-AS1-210ENST00000561256 TLR9Q9NR96 1032 aa19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms