RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEX33O43247 280 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SORBS3O60504 671 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPAG1Q07617 926 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC102AQ96A19 550 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTAGE1Q96RT6 745 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 THAP9Q9H5L6 903 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAB2Q9NYJ8 693 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 DOCK5Q9H7D0 1870 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 TGFB3P10600 412 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SP2Q02086 613 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 FILIP1LQ4L180 1135 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEPT14Q6ZU15 432 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 C1orf186Q6ZWK4 172 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SFR1Q86XK3 245 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC8AQ8IWT6 810 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 HHIPL1Q96JK4 782 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 VPS16Q9H269 839 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC9A2Q9UBY0 812 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 PYCARDQ9ULZ3 195 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa19.76■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGEF35A5YM69 484 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SFI1A8K8P3 1242 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBCAO75347 108 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 UGCGQ16739 394 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 C4orf19Q8IY42 314 aa19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADORA2AP29274 412 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 COPB1P53618 953 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 GSDMDP57764 484 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSMC5P62195 406 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SP4Q02446 784 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF792Q3KQV3 632 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFNL1Q8IU54 200 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 NELFCDQ8IXH7 590 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCND2Q9NZV8 630 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 TELO2Q9Y4R8 837 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC10BA6NIK2 292 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASB14A6NK59 587 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM88BA6NKF7 163 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 N4BP3O15049 544 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAPK4P31152 587 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR142Q7Z601 462 aa19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLXNB2O15031 1838 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM13AO94988 1023 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 CASP5P51878 434 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACTR2P61160 394 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRB14Q14449 540 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARMCX5Q6P1M9 558 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNV1Q6PIU1 500 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCFD1Q8WVM8 642 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSG101Q99816 390 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa19.73■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 TOMM70O94826 608 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSAPP07602 524 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SREBF2Q12772 1141 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEDD9Q14511 834 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABHD15Q6UXT9 468 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM150BA6NC51 233 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATG7O95352 703 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYBP10242 640 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC63Q05C16 580 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA8FQ08AF8 430 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 PADI6Q6TGC4 694 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYFIP1Q7L576 1253 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 EEPD1Q7L9B9 569 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLEKHH3Q7Z736 793 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYCT1Q8N699 235 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SH2D3AQ9BRG2 576 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 CPA4Q9UI42 421 aa19.72■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 GAP43P17677 238 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 YWHABP31946 246 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 RARRES1P49788 294 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAEAQ7L5Y9 396 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM114A1Q8IWE2 563 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC150Q8NCX0 1101 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP6V0A1Q93050 837 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKEF1Q9NU02 776 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 GABBR1Q9UBS5 961 aa19.71■□□□□ 0.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms