RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PICK1Q9NRD5 415 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 EXOC1Q9NV70 894 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 LGSNQ5TDP6 509 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 HVCN1Q96D96 273 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 HAUS8Q9BT25 410 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 SENP2Q9HC62 589 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 BARHL2Q9NY43 387 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PDP2Q9P2J9 529 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC189A1A4V9 331 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 MX2P20592 715 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 NR1H3Q13133 447 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PSMD6Q15008 389 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PRR16Q569H4 304 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 LONP2Q86WA8 852 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 MFN1Q8IWA4 741 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF384Q8TF68 577 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF653Q96CK0 615 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 VPS33BQ9H267 617 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 FOCADQ5VW36 1801 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 A0A087WWV3 80 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 SNAP23O00161 211 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 STXBP3O00186 592 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PHEXP78562 749 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TXNRD1Q16881 649 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 CNKSR1Q969H4 720 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 INTUQ9ULD6 942 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 C6orf229H3BNL8 230 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 SH3BP5O60239 455 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PSEN1P49768 467 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 SESTD1Q86VW0 696 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TEKT4Q8WW24 435 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 FLT1P17948 1338 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 ENC1O14682 589 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 BLVRAP53004 296 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 MAP3K7CLP57077 242 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 ARID5AQ03989 594 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 AIFM3Q96NN9 605 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 RASA1P20936 1047 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 CDK8P49336 464 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TEKT1Q969V4 418 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM47Q96LD4 638 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 NOX5Q96PH1 765 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 IWS1Q96ST2 819 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 COL4A1P02462 1669 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 ABL2P42684 1182 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 KCNB1Q14721 858 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 SPATA1Q5VX52 437 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 MAP3K7O43318 606 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 MGEA5O60502 916 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-214ENST00000540109 TULP2O00295 520 aa6.54□□□□□ -1.36
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