RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	INSRR	P14616	1297 aa		14.03	□□□□□ -0.16
BBS1-222	ENST00000533557	KCNA2	P16389	499 aa		14.03	□□□□□ -0.16
BBS1-222	ENST00000533557	NUBP1	P53384	320 aa		14.03	□□□□□ -0.16
BBS1-222	ENST00000533557	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		14.03	□□□□□ -0.16
BBS1-222	ENST00000533557	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		14.03	□□□□□ -0.16
BBS1-222	ENST00000533557	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		14.03	□□□□□ -0.16
BBS1-222	ENST00000533557	ADSSL1	Q8N142	457 aa		14.03	□□□□□ -0.16
BBS1-222	ENST00000533557	NEK1	Q96PY6	1258 aa		14.03	□□□□□ -0.16
BBS1-222	ENST00000533557	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
BBS1-222	ENST00000533557	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PI15	O43692	258 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	ASGR2	P07307	311 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	WEE2	P0C1S8	567 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	SDS	P20132	328 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	KANK3	Q6NY19	840 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	IL25	Q9H293	177 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	POMK	Q9H5K3	350 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	CWH43	Q9H720	699 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM260	Q9NX78	707 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	KAT6A	Q92794	2004 aa		14.02	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	MEIS2	O14770	477 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	STAM2	O75886	525 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	STAG3L1	P0CL83	205 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	ITGB5	P18084	799 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	UBE3A	Q05086	875 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	GRM4	Q14833	912 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB33	Q86T24	672 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	RSPH3	Q86UC2	560 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	CACNA1B	Q00975	2339 aa		14.01	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	FGFR1	P11362	822 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	NPR3	P17342	541 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PBX3	P40426	434 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	RILPL2	Q969X0	211 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557		C9IYK1	514 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PAK2	Q13177	524 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	IER5	Q5VY09	327 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	GLG1	Q92896	1179 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	KRT37	O76014	449 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	TROAP	Q12815	778 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM2	Q99965	735 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	CEP250	Q9BV73	2442 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	NT5C2	P49902	561 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	FAM189B	P81408	668 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.97	□□□□□ -0.17

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