RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 RTP1P59025 263 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 COG2Q14746 738 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PPP2R5AQ15172 486 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NCAPH2Q6IBW4 605 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CHST13Q8NET6 341 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 REPS2Q8NFH8 660 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 DNERQ8NFT8 737 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SLC39A7Q92504 469 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 STRA6Q9BX79 667 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TMEM206Q9H813 350 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 FBXO40Q9UH90 709 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 BCS1LQ9Y276 419 aa8.32□□□□□ -1.08
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PACS1-211ENST00000531298 PTPRFP10586 1907 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 WDR81Q562E7 1941 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PFASO15067 1338 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 B4DLN1 442 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 EML1O00423 815 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TRAF5O00463 557 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PJA2O43164 708 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PPP1R37O75864 691 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 FLOT1O75955 427 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PRLRP16471 622 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ITGB5P18084 799 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ICAM3P32942 547 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PSEN1P49768 467 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ERVK-24P63145 666 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ADAM9Q13443 819 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CCDC174Q6PII3 467 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 WDR59Q6PJI9 974 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NLRX1Q86UT6 975 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CEP112Q8N8E3 955 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 REEP2Q9BRK0 252 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 DMAC2Q9NW81 257 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.31□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 WDR90Q96KV7 1748 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 RASSF10A6NK89 507 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 WDR64B1ANS9 1081 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 H0YCG3 227 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 IRF6O14896 467 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 FAM13AO94988 1023 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CCND2P30279 289 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PRKCIP41743 596 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ARHGAP25P42331 645 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 GNG11P61952 73 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PSMC5P62195 406 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 RPS6P62753 249 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 ITIH3Q06033 890 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PGM5Q15124 567 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 GNPTABQ3T906 1256 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NEK11Q8NG66 645 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PACS1-211ENST00000531298 BAP1Q92560 729 aa8.3□□□□□ -1.08
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