RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 GBF1Q92538 1859 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 CAND2O75155 1236 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 IGBP1P78318 339 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 SHHQ15465 462 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 UGCGQ16739 394 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC38Q5R3I4 469 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM167AQ96KS9 214 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.023e-10■□□□□ 8.9
PACSIN3-208ENST00000531226 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPRSQ13332 1948 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 EML1O00423 815 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF862O60290 1169 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 PFKMP08237 780 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 ACRP10323 421 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 THPOP40225 353 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM240Q5SV17 173 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 VWCEQ96DN2 955 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 MTMR9Q96QG7 549 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 OATP04181 439 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 PDCP20941 246 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 PRKCEQ02156 737 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF174Q15697 407 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 RPAINQ86UA6 219 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF365Q70YC5 407 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 OR52Z1P0C646 297 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 TXKP42681 527 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMC5P62195 406 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 NBR1Q14596 966 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 GPNMBQ14956 572 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 EPHA7Q15375 998 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 BANK1Q8NDB2 785 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 NBNO60934 754 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 FGBP02675 491 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 CTSHP09668 335 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 RSPH10BP0C881 870 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 KLRC1P26715 233 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 RSPH3Q86UC2 560 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 STBD1O95210 358 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 C22orf31O95567 290 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 CXCL10P02778 98 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 MBTPS1Q14703 1052 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 XKR3Q5GH77 459 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM26DQ5JW98 314 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 RASIP1Q5U651 963 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 HERVK_113Q902F9 699 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 POTEMA6NI47 508 aa21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 SYT1P21579 422 aa21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 LXNQ9BS40 222 aa21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 MAGEB2O15479 319 aa21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 ACTN1P12814 892 aa21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 MGAT3Q09327 533 aa21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3-208ENST00000531226 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
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