RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525274.5

TSTA3-203, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-203ENST00000525274 PRKCEQ02156 737 aa28.21■■■□□ 2.11
TSTA3-203ENST00000525274 EPHA7Q15375 998 aa28.21■■■□□ 2.11
TSTA3-203ENST00000525274 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.21■■■□□ 2.11
TSTA3-203ENST00000525274 BRAPQ7Z569 592 aa28.21■■■□□ 2.11
TSTA3-203ENST00000525274 RGL1Q9NZL6 768 aa28.21■■■□□ 2.11
TSTA3-203ENST00000525274 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TSTA3-203ENST00000525274 POTEMA6NI47 508 aa28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 RRN3P2A6NIE6 340 aa28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 CSF2RAP15509 400 aa28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 TECP42680 631 aa28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 EPHB4P54760 987 aa28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 BFSP2Q13515 415 aa28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 FAM173BQ6P4H8 233 aa28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 DYDC2Q96IM9 177 aa28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 TUBE1Q9UJT0 475 aa28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 TMEM150BA6NC51 233 aa28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 STBD1O95210 358 aa28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 OATP04181 439 aa28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 FPGSQ05932 587 aa28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 RETREG2Q8NC44 543 aa28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 TET1Q8NFU7 2136 aa28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 ZBTB42B2RXF5 422 aa28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 CKBP12277 381 aa28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 PSMC5P62195 406 aa28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 CYP4A11Q02928 519 aa28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 TMEM199Q8N511 208 aa28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 CAGE1Q8TC20 777 aa28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 PRO3102Q9H379 93 aa28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 PITPNM1O00562 1244 aa28.17■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 P4HBP07237 508 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 IQCF3P0C7M6 154 aa28.17■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 THPOP40225 353 aa28.17■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 QARSP47897 775 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.17■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 FAM167AQ96KS9 214 aa28.17■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 SH2D3AQ9BRG2 576 aa28.17■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 NRBP2Q9NSY0 501 aa28.17■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 SIP14410 1827 aa28.17■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 ARID2Q68CP9 1835 aa28.17■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 COL1A2P08123 1366 aa28.16■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 ACRP10323 421 aa28.16■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 KLRC1P26715 233 aa28.16■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 RBL2Q08999 1139 aa28.16■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 BECN1Q14457 450 aa28.16■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 IL17AQ16552 155 aa28.16■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 MTHFD1LQ6UB35 978 aa28.16■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 LXNQ9BS40 222 aa28.16■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.15■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 SLITRK3O94933 977 aa28.15■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 SELPP16109 830 aa28.15■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 BMP8BP34820 402 aa28.15■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 PKP1Q13835 747 aa28.15■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.15■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.15■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 TPH2Q8IWU9 490 aa28.15■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 DNAJB3Q8WWF6 145 aa28.15■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 CTSHP09668 335 aa28.14■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.12e-8■■■■□ 26.7
TSTA3-203ENST00000525274 MTERF2Q49AM1 385 aa28.14■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 XKR3Q5GH77 459 aa28.14■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.14■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.14■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 VWCEQ96DN2 955 aa28.14■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.14■■■□□ 2.1
TSTA3-203ENST00000525274 ZBTB39O15060 712 aa28.13■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 TMEM266Q2M3C6 531 aa28.13■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.13■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 PLA2G4FQ68DD2 849 aa28.13■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 ANO5Q75V66 913 aa28.13■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 HSD17B14Q9BPX1 270 aa28.13■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 CLIC4Q9Y696 253 aa28.13■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 A0A087WWV3 80 aa28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 LAD1O00515 517 aa28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 C22orf31O95567 290 aa28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 GPNMBQ14956 572 aa28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 IL23AQ9NPF7 189 aa28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-203ENST00000525274 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms