RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 PSAPP07602 524 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 KCNJ6P48051 423 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 IKBKEQ14164 716 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 LRCH2Q5VUJ6 765 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 MOXD1Q6UVY6 613 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 ETNPPLQ8TBG4 499 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 MYLIPQ8WY64 445 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 TEKT3Q9BXF9 490 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 UNC45AQ9H3U1 944 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 DISC1Q9NRI5 854 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 GABBR1Q9UBS5 961 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 SAMM50Q9Y512 469 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.93■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 ZBTB42B2RXF5 422 aa15.93■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 CHMP2AO43633 222 aa15.93■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 KRT2P35908 639 aa15.93■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 MGAT3Q09327 533 aa15.93■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 NEK8Q86SG6 692 aa15.93■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 RSPH3Q86UC2 560 aa15.93■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.93■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 TNFRSF25Q93038 417 aa15.93■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF862O60290 1169 aa15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 GHRP10912 638 aa15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 KLRC1P26715 233 aa15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 KRT40Q6A162 431 aa15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 MTHFD1LQ6UB35 978 aa15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 B3GNT9Q6UX72 402 aa15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 SEPT8Q92599 483 aa15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 CDY2AQ9Y6F7 541 aa15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa15.92■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 BTBD18B2RXH4 712 aa15.91■□□□□ 0.14
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PDGFRB-202ENST00000517488 EFCAB14O75071 495 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 ARHGEF15O94989 841 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 MMP1P03956 469 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 CA3P07451 260 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 GUCY1B3Q02153 619 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM62Q0P6H9 643 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 LPIN1Q14693 890 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 RABEP1Q15276 862 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 UGCGQ16739 394 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF484Q5JVG2 852 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15.91■□□□□ 0.14
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PDGFRB-202ENST00000517488 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 KCNMB3Q9NPA1 279 aa15.91■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa15.9■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF28PB7ZC32 967 aa15.9■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 TLL1O43897 1013 aa15.9■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 SFNP31947 248 aa15.9■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 JAK3P52333 1124 aa15.9■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 TRIM29Q14134 588 aa15.9■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 FBXO47Q5MNV8 452 aa15.9■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM117BQ6P1L5 589 aa15.9■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 MIER3Q7Z3K6 550 aa15.9■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 PRDM12Q9H4Q4 367 aa15.9■□□□□ 0.14
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PDGFRB-202ENST00000517488 EYSQ5T1H1 3165 aa15.9■□□□□ 0.14
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PDGFRB-202ENST00000517488 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
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PDGFRB-202ENST00000517488 EML1O00423 815 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 WNT7AO00755 349 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 GJB5O95377 273 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 C22orf31O95567 290 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 FOSL2P15408 326 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 PRKCEQ02156 737 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 IER5Q5VY09 327 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 POTEDQ86YR6 584 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 RDM1Q8NG50 284 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 HAS1Q92839 578 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM167AQ96KS9 214 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM20AQ96MK3 541 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 VAV3Q9UKW4 847 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 TRPV2Q9Y5S1 764 aa15.89■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 AMHP03971 560 aa15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 OATP04181 439 aa15.88■□□□□ 0.13
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