RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	NENF	Q9UMX5	172 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NFS1	Q9Y697	457 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LAMB1	P07942	1786 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SHTN1	A0MZ66	631 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	AKR1B10	O60218	316 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GFRA3	O60609	400 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SERPING1	P05155	500 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SMARCA1	P28370	1054 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ECHS1	P30084	290 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LSP1	P33241	339 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	AMPD3	Q01432	767 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TFAP4	Q01664	338 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNMA1	Q12791	1236 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP58	Q5T655	872 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	C8orf74	Q6P047	294 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZNB5	142 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SV2B	Q7L1I2	683 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	RRAGA	Q7L523	313 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	WHAMM	Q8TF30	809 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	RAD54L	Q92698	747 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MS4A14	Q96JA4	679 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	DRC1	Q96MC2	740 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	HINFP	Q9BQA5	517 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GAN	Q9H2C0	597 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP72	Q9P209	647 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SLAIN2	Q9P270	581 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NOD1	Q9Y239	953 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SNED1	Q8TER0	1413 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP8B3	O60423	1300 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MYH8	P13535	1937 aa		5.46	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		5.46	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	C5orf60	A6NFR6	353 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPY2	A6NKD2	308 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFAB1	O14561	156 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PALM	O75781	387 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PAEP	P09466	180 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NR1D1	P20393	614 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RASA1	P20936	1047 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PRDX5	P30044	214 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CXCR5	P32302	372 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PAFAH1B1	P43034	410 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SCTR	P47872	440 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ERVK-9	P63128	1117 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RASSF7	Q02833	373 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GUCY2D	Q02846	1103 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DDR1	Q08345	913 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PSMD2	Q13200	908 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DRP2	Q13474	957 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PDIA5	Q14554	519 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SEPT2	Q15019	361 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PLCB4	Q15147	1175 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TRADD	Q15628	312 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	HYI	Q5T013	277 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC181	Q5TID7	509 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NAA35	Q5VZE5	725 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		5.46	□□□□□ -1.54

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