RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DOK1	Q99704	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159		A0A0G2JLW4	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RAD21	O60216	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CSF1R	P07333	972 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	COL6A2	P12110	1019 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RARG	P13631	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	VAV2	P52735	878 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	EHHADH	Q08426	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GALNT2	Q10471	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PAK2	Q13177	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	HAUS7	Q99871	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GDF15	Q99988	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	BPTF	Q12830	3046 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RGS13	O14921	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	KIF3B	O15066	747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FLT3	P36888	993 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	EVX2	Q03828	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GRIN1	Q05586	938 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CNGA2	Q16280	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NUP98	P52948	1817 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159		M0R2N6	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADAM23	O75077	832 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DGKI	O75912	1065 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FUT2	Q10981	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CBX3	Q13185	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	IKZF1	Q13422	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	E2F5	Q15329	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms