RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514654.5

ATP2C1-222, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 1 (best)

Gene ATP2C1, Length 4,730 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-222	ENST00000514654	LXN	Q9BS40	222 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF233	A6NK53	670 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	ADCY1	Q08828	1119 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	TROAP	Q12815	778 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	MTMR3	Q13615	1198 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRIM50	Q86XT4	487 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PALM2	Q8IXS6	379 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	MST1R	Q04912	1400 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	DPEP1	P16444	411 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PLTP	P55058	493 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	CASP7	P55210	303 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	GNGT1	P63211	74 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	GEN1	Q17RS7	908 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	NME8	Q8N427	588 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	CABS1	Q96KC9	395 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRIM9	Q9C026	710 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	EPC1	Q9H2F5	836 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	DENND3	A2RUS2	1198 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654		H7C0C1	242 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	ATP5O	P48047	213 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	KIF22	Q14807	665 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	IQCB1	Q15051	598 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	CEP55	Q53EZ4	464 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	CCDC125	Q86Z20	511 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	STXBP3	O00186	592 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	MAN1A1	P33908	653 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	STK4	Q13043	487 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	ATF2	P15336	505 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	FGFR2	P21802	821 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	ALDH3A1	P30838	453 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	JAK3	P52333	1124 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PASD1	Q8IV76	773 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	USP11	P51784	963 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	CLDN3	O15551	220 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PALM	O75781	387 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	STX2	P32856	288 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	PSMC4	P43686	418 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	CLCN6	P51797	869 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATP2C1-222	ENST00000514654	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		6.68	□□□□□ -1.34

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