RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJB2P25686 324 aa23.79■■□□□ 1.4
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SH3BP2-210ENST00000505941 GHRP10912 638 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP2B1P20020 1258 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMC5P62195 406 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 XKR3Q5GH77 459 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.7■■□□□ 1.38
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