RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	PTPRN2	Q92932	1015 aa		5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	EXOC2	Q96KP1	924 aa		5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	AMN	Q9BXJ7	453 aa		5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		5.84	□□□□□ -1.47
USP34-222	ENST00000498268	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	PDPK1	O15530	556 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CUTA	O60888	179 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	MPIG6B	O95866	241 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	KCNQ1	P51787	676 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	GUCY1A3	Q02108	690 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	TM4SF20	Q53R12	229 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	HS1BP3	Q53T59	392 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	MIIP	Q5JXC2	388 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CFHR4	Q92496	578 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	EDA	Q92838	391 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	INCENP	Q9NQS7	918 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	GALNT8	Q9NY28	637 aa		5.83	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	AQP7	O14520	342 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CDC14B	O60729	498 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	RAD17	O75943	681 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CRTAM	O95727	393 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	PTGS1	P23219	599 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	AOAH	P28039	575 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	ETV4	P43268	484 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	WNK4	Q96J92	1243 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CDC6	Q99741	560 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	NR2E1	Q9Y466	385 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CCDC66	A2RUB6	948 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	DNM2	P50570	870 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CD83	Q01151	205 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	FOXL1	Q12952	345 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	RASGRF1	Q13972	1273 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	STIL	Q15468	1287 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	USP51	Q70EK9	711 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	DPH6	Q7L8W6	267 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	OR14A2	Q96R54	314 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	MME	P08473	750 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	C1S	P09871	688 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	PCOLCE	Q15113	449 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	MTERF2	Q49AM1	385 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	FIGN	Q5HY92	759 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	IL17D	Q8TAD2	202 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	ARHGAP6	O43182	974 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	HMGCR	P04035	888 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	ST5	P78524	1137 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	NFYC	Q13952	458 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CRY1	Q16526	586 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	KANK2	Q63ZY3	851 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	GPR135	Q8IZ08	494 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	SCYL1	Q96KG9	808 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		5.79	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	RASSF10	A6NK89	507 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	SCD	O00767	359 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	ECE1	P42892	770 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	FHL2	Q14192	279 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	USP30	Q70CQ3	517 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48

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