RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 NDUFAB1O14561 156 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 CETN3O15182 167 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ZBTB14O43829 449 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 PLOD3O60568 738 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP6V1G1O75348 118 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ITGB1P05556 798 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 STMN1P16949 149 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 CUL4BQ13620 913 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC14A2Q15849 920 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 USH1GQ495M9 461 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 NLRP10Q86W26 655 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 PGBD3Q8N328 593 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 AADATQ8N5Z0 425 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ASB16Q96NS5 453 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM4Q9C037 500 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 BATF3Q9NR55 127 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 NCAPD2Q15021 1401 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 BTBD11A6QL63 1104 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L5A8MUK1 530 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP9BO43861 1147 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 AHCYL1O43865 530 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 UPP2O95045 317 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 INMTO95050 263 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 AGR2O95994 175 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 RXRGP48443 463 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 MTHFSP49914 203 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 USP4Q13107 963 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 STIM1Q13586 685 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 PSMD6Q15008 389 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 OASLQ15646 514 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ADALQ6DHV7 355 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC170Q8IYT3 715 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 KCT2Q8NC54 265 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 MDM1Q8TC05 714 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 KIFC2Q96AC6 838 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 SAAL1Q96ER3 474 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 GPR108Q9NPR9 543 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 TNS2Q63HR2 1409 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ENO4A6NNW6 628 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ERLIN2O94905 339 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 SCGB1D2O95969 90 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP2R1AP30153 589 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 CCT5P48643 541 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 DAB2P98082 770 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ZBTB16Q05516 673 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 BNIP1Q12981 228 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 NCOA4Q13772 614 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 NFE2L1Q14494 772 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 SMUG1Q53HV7 270 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 METTL11BQ5VVY1 283 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 NUGGCQ68CJ6 796 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 VPS52Q8N1B4 723 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-214ENST00000497648 KIF18AQ8NI77 898 aa9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms