RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 FAM228BP0C875 321 aa23.44■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 ACTN1P12814 892 aa23.44■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 SLC9A1P19634 815 aa23.44■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.44■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 EXOC4Q96A65 974 aa23.44■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 WDR18Q9BV38 432 aa23.44■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 SFI1A8K8P3 1242 aa23.43■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 CHMP2AO43633 222 aa23.43■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 NR3C1P04150 777 aa23.43■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
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CERKL-213ENST00000494398 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.43■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 BMT2Q1RMZ1 405 aa23.43■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.43■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 SPAG5Q96R06 1193 aa23.43■■□□□ 1.34
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CERKL-213ENST00000494398 TSKSQ9UJT2 592 aa23.43■■□□□ 1.34
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CERKL-213ENST00000494398 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.43■■□□□ 1.34
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CERKL-213ENST00000494398 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.43■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.43■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.43■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.43■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 SLITRK3O94933 977 aa23.42■■□□□ 1.34
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CERKL-213ENST00000494398 GAP43P17677 238 aa23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 DLGAP5Q15398 846 aa23.42■■□□□ 1.34
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CERKL-213ENST00000494398 FAM151AQ8WW52 585 aa23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 MED4Q9NPJ6 270 aa23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 FAM13AO94988 1023 aa23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 KCNA1Q09470 495 aa23.42■■□□□ 1.34
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CERKL-213ENST00000494398 DYDC2Q96IM9 177 aa23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 LRRC1Q9BTT6 524 aa23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 ASTN1O14525 1302 aa23.42■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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CERKL-213ENST00000494398 PALMO75781 387 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 PSMD10O75832 226 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 KLRC1P26715 233 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 PON1P27169 355 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 UBXN2AP68543 259 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 OGFOD1Q8N543 542 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 MYCT1Q8N699 235 aa23.41■■□□□ 1.34
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CERKL-213ENST00000494398 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 MYH10P35580 1976 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 PHACTR2O75167 634 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 RAD17O75943 681 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 MYBL2P10244 700 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 CASP4P49662 377 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 PPP2R5CQ13362 524 aa23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.41■■□□□ 1.34
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CERKL-213ENST00000494398 LMAN1P49257 510 aa23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 SLC5A5Q92911 643 aa23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 PSD3Q9NYI0 1048 aa23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 EHD2Q9NZN4 543 aa23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 PTK2Q05397 1052 aa23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 HPCAL4Q9UM19 191 aa23.4■■□□□ 1.34
CERKL-213ENST00000494398 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
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CERKL-213ENST00000494398 CEP55Q53EZ4 464 aa23.39■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.39■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 GBP6Q6ZN66 633 aa23.39■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.39■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.39■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 PACSIN1Q9BY11 444 aa23.39■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 VEZTQ9HBM0 779 aa23.39■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 PRELPP51888 382 aa23.38■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 EPHA7Q15375 998 aa23.38■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 TAF3Q5VWG9 929 aa23.38■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 SLC35C1Q96A29 364 aa23.38■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 VCPKMTQ9H867 229 aa23.38■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 PARVGQ9HBI0 331 aa23.38■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 RNF14Q9UBS8 474 aa23.38■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CERKL-213ENST00000494398 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
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