RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 ZNF747Q9BV97 191 aa6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 BTBD7Q9P203 1132 aa6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 CUTAO60888 179 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 AOAHP28039 575 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 GJA4P35212 333 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 CRY1Q16526 586 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 TM4SF20Q53R12 229 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 VPS11Q9H270 941 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 INCENPQ9NQS7 918 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 RASGRP1O95267 797 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 MPIG6BO95866 241 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 AMHP03971 560 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 ADCY8P40145 1251 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 TBR1Q16650 682 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 FUKQ8N0W3 1084 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 AMNQ9BXJ7 453 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 MATN2O00339 956 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 SUV39H1O43463 412 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 NAT1P18440 290 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 ETV4P43268 484 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 GALNT8Q9NY28 637 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 SNTG2Q9NY99 539 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 GSTA4O15217 222 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 SLPIP03973 132 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 MMEP08473 750 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 KCNQ1P51787 676 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 HMGA2P52926 109 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 RAC3P60763 192 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 STILQ15468 1287 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 SCDO00767 359 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 ACVRL1P37023 503 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 HERVK_113P62684 666 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 USP51Q70EK9 711 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 SCLYQ96I15 445 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 WNK4Q96J92 1243 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 ADOQ96SZ5 270 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 DNAJC7Q99615 494 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 NR2E1Q9Y466 385 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 RASSF10A6NK89 507 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 FZD7O75084 574 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 HMGCRP04035 888 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 CR2P20023 1033 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 CD83Q01151 205 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 DUSP8Q13202 625 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 HS1BP3Q53T59 392 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 AGBL4Q5VU57 503 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 KANK2Q63ZY3 851 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 SCYL1Q96KG9 808 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 C8orf37Q96NL8 207 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 CYR61O00622 381 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 CDC14BO60729 498 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 RAD17O75943 681 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 ECE1P42892 770 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 RBL2Q08999 1139 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 Q6ZSN1 163 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 ASB15Q8WXK1 588 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 CFHR4Q92496 578 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 MRIQ9BWK5 157 aa6.73□□□□□ -1.33
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