RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 EFHBQ8N7U6 833 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ASB15Q8WXK1 588 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM84AQ96KN4 292 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ZSWIM3Q96MP5 696 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 NOX5Q96PH1 765 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 GORASP1Q9BQQ3 440 aa4.55□□□□□ -1.68
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RABGGTB-211ENST00000489450 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 MCM8Q9UJA3 840 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR39O43194 453 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ZEB2O60315 1214 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 BRINP1O60477 761 aa4.54□□□□□ -1.68
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RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM253P0C7T8 217 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 C1QTNF9P0C862 333 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 GLDCP23378 1020 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 AOAHP28039 575 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGA1P56199 1179 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SSPNQ14714 243 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF19Q5T6S3 580 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 VASNQ6EMK4 673 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ATG14Q6ZNE5 492 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 C11orf74Q86VG3 221 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 HIPK4Q8NE63 616 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR66Q8TBY9 1149 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 GBP4Q96PP9 640 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 MS4A5Q9H3V2 200 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ACSS2Q9NR19 701 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 HSPBP1Q9NZL4 362 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 BTBD7Q9P203 1132 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 IRAK3Q9Y616 596 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PDS5BQ9NTI5 1447 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 LCHNA4D1U4 455 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 TCAF2A6NFQ2 919 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF839A8K0R7 811 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 NFIBO00712 420 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 MED14OSP0DP75 135 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PI3P19957 117 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 HERVK_113P62684 666 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 IGBP1P78318 339 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PFKPQ01813 784 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM9Q13443 819 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
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RABGGTB-211ENST00000489450 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PASD1Q8IV76 773 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 COG1Q8WTW3 980 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC5A5Q92911 643 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SIGLEC10Q96LC7 697 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC38A3Q99624 504 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 ZMAT4Q9H898 229 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 UCKL1Q9NWZ5 548 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-211ENST00000489450 FANCD2Q9BXW9 1451 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 CEP164Q9UPV0 1460 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 MPIG6BO95866 241 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP17A1P05093 508 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 PTGS1P23219 599 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 GLRBP48167 497 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 FNTBP49356 437 aa4.52□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 RTP5Q14D33 572 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 TERF2Q15554 542 aa4.52□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 DDB1Q16531 1140 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 BROXQ5VW32 411 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM129CQ86XR2 697 aa4.52□□□□□ -1.69
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RABGGTB-211ENST00000489450 DTX3Q8N9I9 347 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 C16orf92Q96LL3 132 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM209Q96SK2 561 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R16BQ96T49 567 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 VTA1Q9NP79 307 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-211ENST00000489450 CD320Q9NPF0 282 aa4.52□□□□□ -1.69
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