RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 IWS1Q96ST2 819 aa11.51□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.51□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.51□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 KCND2Q9NZV8 630 aa11.51□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.51□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR64B1ANS9 1081 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CNMDO75829 334 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 LYPLA2O95372 231 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC25A27O95847 323 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 TPM2P07951 284 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SKILP12757 684 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PBX1P40424 430 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CCZ1BP86790 482 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC41Q15345 812 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CCL15Q16663 113 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 GNPTABQ3T906 1256 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SFR1Q86XK3 245 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PAGR1Q9BTK6 254 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SAMM50Q9Y512 469 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.5□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 LGALS16A8MUM7 142 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 POTEB2H3BUK9 544 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 TEX33O43247 280 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 FKTNO75072 461 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP9AO75110 1047 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM13AO94988 1023 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 GTF2A2P52657 109 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 STXBP2Q15833 593 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CREBRFQ8IUR6 639 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 VPS16Q9H269 839 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PNMA3Q9UL41 463 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 NFASCO94856 1347 aa11.49□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 B4DLN1 442 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PEX10O60683 326 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CCNE2O96020 404 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 RSPH10BP0C881 870 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CETPP11597 493 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNA2P16389 499 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ERCC3P19447 782 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 GUCY2CP25092 1073 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 RGS19P49795 217 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMC5P62195 406 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CNTN2Q02246 1040 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM14Q14142 442 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPN21Q16825 1174 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 BMT2Q1RMZ1 405 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC55Q6ZSA7 311 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 PPFIBP1Q86W92 1011 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 RBPJLQ9UBG7 517 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SEL1LQ9UBV2 794 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ADGRA2Q96PE1 1338 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 LCTP09848 1927 aa11.48□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE4BO95155 1302 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 BTBD19C9JJ37 291 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB39O15060 712 aa11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
GTPBP1-211ENST00000487538 RGS20O76081 388 aa11.47□□□□□ -0.57
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